能否起诉房屋承租人的公司，需视具体情况而定，但总体而言，在具备正当理由且证据充分的情况下，是可以起诉的。以下从不同角度进行分析：
一、若承租人以公司名义签订租赁合同
合同相对性原则：
- 若租赁合同是由承租人所在的公司作为一方签订，那么该公司即为合同的一方当事人。根据合同相对性原则，当公司违反合同约定时，出租人有权直接起诉该公司，要求其承担违约责任。
- 实例说明：如某公司以自身名义租赁房屋作为办公场所，但未按约定支付租金，出租人可依据租赁合同直接起诉该公司，要求支付租金及违约金。
证据收集：
- 在起诉前，出租人应收集相关证据，如租赁合同、租金支付记录、沟通记录等，以证明公司存在违约行为。
二、若承租人以个人名义签订租赁合同，但公司实际使用房屋
名义与实际使用人不一致的情况：
- 在这种情况下，虽然租赁合同是由承租人个人签订，但房屋实际由公司使用。若公司因使用房屋而产生纠纷（如损坏房屋设施、拖欠物业费等），出租人原则上应先向承租人主张权利。
- 但：若出租人能证明公司实际参与了租赁关系的履行（如公司直接支付租金、公司员工实际居住等），且该行为得到了承租人的同意或默许，出租人也可能有权将公司列为共同被告或第三人，要求其承担相应责任。不过，这需要根据具体案情和证据来判断。
法律建议：
- 在签订租赁合同时，出租人应明确租赁目的和使用人，并在合同中约定若实际使用人与名义承租人不一致时的责任承担方式。
- 若发现公司实际使用房屋且存在违约行为，出租人应及时收集证据，并与承租人及公司进行沟通协商。若协商无果，可考虑通过法律途径解决。
三、若承租人行为构成表见代理或职务行为
表见代理：
- 若承租人以公司名义签订租赁合同，且出租人有理由相信承租人有权代表公司签订合同（如承租人持有公司授权书、公章等），则可能构成表见代理。在这种情况下，出租人有权起诉公司要求其承担合同责任。
职务行为：
- 若承租人是公司员工，且其签订租赁合同的行为属于职务行为（即为了公司的利益而履行职责），则公司应承担相应的法律责任。出租人可起诉公司要求其履行合同义务或赔偿损失。
四、起诉前的准备与协商
- 证据收集：无论哪种情况，出租人在起诉前都应尽可能收集相关证据，如租赁合同、租金支付记录、沟通记录、房屋使用情况照片或视频等，以证明自己的权益受到侵害。
- 协商解决：建议先与承租人及公司进行沟通协商，尝试通过友好方式解决争议。这可以节省时间和成本，并避免不必要的法律纠纷。
- 法律途径：若协商无果，出租人可依法向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结来说，能否起诉房屋承租人的公司取决于多种因素，包括租赁合同的签订主体、房屋的实际使用情况、承租人的行为性质等。在具备正当理由且证据充分的情况下，出租人是有权起诉公司的。若您遇到类似问题，可直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。