核心结论：在交通事故中对方全责且公司已报工伤的情况下，您可同时主张交通事故赔偿和工伤保险待遇，二者可并行赔付，但医疗费用部分需遵循“补差原则”。以下是具体理赔流程及注意事项：

1. 交通事故赔偿与工伤保险待遇的并行性

根据《社会保险法》第42条及《工伤保险条例》相关规定，因第三人侵权导致的工伤，劳动者可同时主张交通事故赔偿和工伤保险待遇，但医疗费用部分不得重复获赔（即“补差原则”）。具体而言：

• 可重复获赔的项目：如伤残赔偿金、误工费（停工留薪期工资）、护理费、营养费、交通费等，可分别按交通事故和工伤标准主张。
• 不可重复获赔的项目：医疗费、住院伙食补助费等实际支出费用，若交通事故赔偿已覆盖，工伤保险不再重复支付；若交通事故赔偿不足，工伤保险可补足差额。

2. 理赔流程与操作步骤

（1）交通事故赔偿部分

• 责任认定：确保交警出具的《交通事故责任认定书》明确对方全责。
• 协商/诉讼：与对方或其保险公司协商赔偿，若协商不成可向法院起诉。
• 赔偿项目：包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、精神损害抚慰金等（具体按《民法典》及司法解释计算）。

（2）工伤保险待遇部分

• 工伤认定：公司需在事故发生后30日内向社保部门申请工伤认定；若公司未申请，您或近亲属可在1年内直接申请。
• 劳动能力鉴定：伤情稳定后，向市级劳动能力鉴定委员会申请伤残等级鉴定。
• 待遇申领：根据鉴定结果，向社保部门申领一次性伤残补助金、医疗补助金、伤残津贴（如构成伤残）及停工留薪期工资（由公司支付）。

3. 关键注意事项

• 医疗费用凭证保留：所有医疗发票、费用清单需留存原件，用于交通事故赔偿和工伤保险报销。若一方已报销，需提供加盖公章的复印件及分割单。
• 时效性：工伤认定申请需在1年内提出，逾期可能丧失权利。
• 赔偿顺序：建议先通过交通事故赔偿获取医疗费，再向工伤保险申请补差（若交通事故赔偿不足）。
• 协议签署谨慎：与对方或保险公司签订赔偿协议时，需明确“放弃后续权利”条款的效力，避免影响工伤待遇申领。

4. 特殊情形处理

• 对方拒赔或无力赔偿：若交通事故赔偿无法到位，可申请工伤保险先行支付（需提供对方无力赔偿的证明，如法院执行终结裁定书）。
• 公司未缴工伤保险：若公司未依法缴纳工伤保险，所有工伤待遇由公司承担，您可直接向公司主张权利。

建议：理赔过程涉及法律程序和证据固定，建议整理好事故认定书、医疗记录、收入证明等材料，必要时可委托律师协助处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询。