在政府部门与施工方还未签订施工合同的情况下，不建议将工程款打进共管账户。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同是法律关系的基石：

   • 在建设工程领域，施工合同是明确双方权利义务、约定工程款支付等关键条款的法律文件。
   • 未签订施工合同意味着双方的权利义务尚未明确，此时支付工程款存在法律风险。

2. 共管账户的性质与用途：

   • 共管账户通常用于双方已签订合同并需共同管理资金的情况。
   • 在没有合同约束的情况下，共管账户的使用可能缺乏明确的法律依据和双方共识。

3. 法律后果与风险：

   • 若未签订合同即支付工程款，一旦后续合同谈判破裂或存在争议，款项的追回可能面临困难。
   • 支付工程款而无合同保障，可能导致政府部门面临资金损失或施工方不当得利的风险。

4. 建议与做法：

   • 在签订施工合同前，双方应就合同条款进行充分协商，并确保合同内容合法、有效。
   • 合同签订后，可根据合同约定设立共管账户，并依据合同约定的支付条件和时间节点支付工程款。
   • 如确需在合同签订前支付部分款项，应通过其他合法、安全的方式（如预付款保证金等）进行，并明确款项的性质、用途及返还条件。

综上所述，为了保障双方的合法权益，避免潜在的法律风险，建议在签订施工合同后再将工程款打进共管账户。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。