关于您提出的“发放工资是否可以以部门为单位”的问题，这是一个涉及公司内部工资管理流程与法律合规性的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、公司内部工资管理流程

在公司内部，工资的管理通常是一个涉及多个部门协同工作的过程。具体来说：

1. 人力资源部门：负责工资的核算工作，包括统计员工的考勤、绩效、加班等数据，并准确核算员工的基本工资、绩效奖金、津贴补贴等。同时，人力资源部门还负责薪资政策的制定与调整，确保薪资体系的公平性和竞争力。

2. 财务部门：在人力资源部门完成工资核算后，财务部门会负责工资的发放工作。他们会根据人力资源部门提供的核算结果，安排资金并确保工资按时、足额发放到员工账户。此外，财务部门还负责工资支出的财务核算与成本控制。

二、工资发放的单位问题

关于工资发放是否可以以部门为单位，这实际上取决于公司的具体管理流程和制度设计。从理论上讲，公司可以选择以部门为单位进行工资发放，但这并不是一种普遍的做法，也不是法律强制要求的。

1. 以部门为单位发放的优点：可能有助于部门内部的管理和激励，使得部门负责人能够更直接地了解和控制本部门的薪酬支出。

2. 以部门为单位发放的缺点：可能增加公司管理的复杂性和成本，因为需要为每个部门单独进行工资核算和发放。此外，如果部门之间存在薪酬差异，还可能引发员工之间的不公平感和不满情绪。

三、法律合规性考虑

无论公司选择何种工资发放方式，都必须严格遵守相关法律法规，确保工资的按时、足额支付，并保障员工的合法权益。这包括遵守《中华人民共和国劳动法》和《劳动保障监察条例》等法律法规，以及确保工资核算和发放的透明度和公正性。

四、建议

1. 综合考虑公司实际情况：公司在决定工资发放方式时，应综合考虑自身的规模、管理流程、员工需求等因素，选择最适合自己的方式。

2. 确保法律合规性：无论选择何种方式，都必须确保符合相关法律法规的要求，避免引发法律纠纷和员工不满。

3. 加强沟通与透明度：公司应加强与员工的沟通，确保员工了解工资核算和发放的流程和标准，提高透明度和公正性。

综上所述，发放工资是否可以以部门为单位并没有固定的答案，而是取决于公司的具体管理流程和制度设计。公司在做出决策时，应综合考虑多种因素，并确保符合相关法律法规的要求。