公司发放工资的单位可以更换，但需满足一定条件并履行相应程序，具体分析如下：

1. 劳动合同约定优先
   若劳动合同中明确约定了工资发放单位（如总公司、关联公司或第三方代发），则更换发放单位需与劳动者协商一致并修改合同条款。未经劳动者书面同意，公司单方面变更可能构成违约，劳动者有权要求按原约定履行或主张经济补偿。

2. 关联公司代发需合法
   若公司通过关联企业（如子公司、分公司）代发工资，需确保：

   • 关联关系真实存在且合法；
     
   • 代发单位具备用工主体资格；
     
   • 工资标准、发放时间等核心条款不变。
     若代发导致劳动者权益受损（如延迟发放、克扣工资），劳动者可向实际用工单位主张权利。

3. 第三方代发需谨慎
   若委托第三方平台（如支付机构）代发，需注意：

   • 签订书面委托协议，明确双方权利义务；
     
   • 确保第三方具备合法资质；
     
   • 保留工资发放记录作为证据。
     若第三方违约导致工资未发放，公司仍需承担最终责任。

4. 程序合法性要求
   更换发放单位时，公司应履行以下程序：

   • 提前通知劳动者并说明理由；
     
   • 协商一致后签订补充协议；
     
   • 确保工资发放标准、时间等不降低劳动者权益。
     若未履行程序，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

风险提示：公司擅自更换工资发放单位可能引发劳动者对劳动关系主体、社保缴纳、经济补偿等问题的争议。建议公司在操作前咨询法律专业人士，确保程序合法合规。如有具体问题，可直接向我咨询。