针对您提出的“在职期间职业病体检不合格公司怎么处理”的问题，这是一个涉及劳动者健康权益和用人单位责任的重要议题。以下是我根据相关法律法规和实际操作经验，为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确职业健康体检的结论类型及其对应的处理措施。根据职业健康检查结果，对劳动者个体的体检结论通常分为以下几种情况：
目前未见异常：
- 这表明本次职业健康检查各项检查指标均在正常范围内。
- 用人单位可以继续安排劳动者从事目前岗位工作。
复查或医学观察：
- 检查时发现与目标疾病相关的单项或多项异常。
- 用人单位应当按照职业健康检查机构要求的时间，安排劳动者进行复查和医学观察。
疑似职业病：
- 职业健康检查发现疑似职业病或可能患有职业病。
- 用人单位需要按照职业健康检查机构的建议，安排劳动者进行医学观察或者职业病诊断，并承担相关费用。
- 在此期间，用人单位不得解除或终止与劳动者的劳动合同。
职业禁忌：
- 有职业禁忌的劳动者比一般职业人群更易于遭受职业病危害和罹患职业病。
- 用人单位应当将其调离或者暂时脱离原工作岗位，不得安排其从事相关接触职业病危害因素的工作。
其他疾病或异常：
- 除目标疾病之外的其他疾病或某些检查指标的异常，与其所接触的职业危害无关。
- 建议劳动者到综合性医院进一步复查诊治。
针对您提到的“职业病体检不合格”的情况，这通常可能对应上述中的“复查或医学观察”、“疑似职业病”或“职业禁忌”等结论。针对这些结论，用人单位应当采取以下措施：
对于需要复查或医学观察的劳动者：
- 用人单位应严格按照职业健康检查机构的要求，安排劳动者进行复查和医学观察，确保劳动者的健康得到及时关注和处理。
对于疑似职业病的劳动者：
- 用人单位应立即按照职业健康检查机构的建议，安排劳动者进行医学观察或职业病诊断，并承担相关费用。
- 同时，用人单位应保障劳动者的合法权益，不得在此期间解除或终止劳动合同。
对于有职业禁忌的劳动者：
- 用人单位应将其调离或暂时脱离原工作岗位，避免其继续接触职业病危害因素。
- 用人单位还应为劳动者提供必要的职业健康保护措施，确保其健康不受进一步损害。
此外，用人单位还应加强职业卫生管理，定期组织劳动者进行职业健康体检，及时发现和处理职业健康问题。同时，劳动者也应知晓自己的健康权益，按时参加体检，保护好自己的健康。
总之，对于在职期间职业病体检不合格的劳动者，用人单位应根据体检结论采取相应的处理措施，确保劳动者的健康权益得到保障。同时，用人单位和劳动者都应加强职业健康意识，共同营造一个健康、安全的工作环境。