结论：在厂工中介每月扣员工200元管理费是否合法，需根据具体情况判断，若该费用扣除缺乏合法依据或未得到员工同意，则不合法。以下从不同角度进行分析：
一、合法性判断依据
劳动合同或规章制度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位（包括中介机构，若其与员工构成劳动关系）与劳动者建立劳动关系时，应当明确约定劳动报酬、福利待遇等条款。若劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了管理费的扣除，且该规定不违反法律、行政法规的强制性规定，同时得到了员工的同意，则扣除管理费可能是合法的。
- 但需注意：规章制度需经过民主程序制定，并向劳动者公示或告知，否则可能因程序瑕疵而被认定为无效。
法律法规的强制性规定：
- 我国法律并未明确规定用人单位可以扣除员工管理费，因此，若中介机构以管理费名义扣除员工工资，且该扣除行为缺乏合法依据（如未在劳动合同中约定，或规章制度未经过民主程序制定等），则该扣除行为可能构成违法。
二、可能存在的违法情形
未经员工同意擅自扣除：
- 若中介机构未经员工同意，擅自以管理费名义扣除员工工资，则该行为可能构成违法。员工有权要求中介机构返还被扣除的费用，并可能因此向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
扣除费用超出合理范围：
- 即使劳动合同或规章制度中规定了管理费的扣除，但若扣除的费用超出了合理范围（如远高于实际管理成本），也可能被认定为违法。此时，员工同样有权要求中介机构返还超出部分的费用。
三、员工应对措施
与中介机构协商：
- 员工可以先与中介机构进行协商，了解扣除管理费的具体原因和依据，并尝试达成和解。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门对中介机构的违法行为进行调查和处理。
提起劳动仲裁或诉讼：
- 若劳动监察部门未能解决问题，员工还可以向劳动争议仲裁委员会提起劳动仲裁，或直接向人民法院提起诉讼，要求中介机构返还被扣除的费用并承担相应的法律责任。
建议：作为员工，在面对中介机构扣除管理费的情况时，应首先了解自己的权益和法律法规的相关规定。若认为中介机构的扣除行为违法或不合理，应及时采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。