机关事业单位对员工进行除名处理，必须严格遵循法定程序，其核心程序要点如下：

1. 事实调查与证据收集
   机关事业单位需对员工涉嫌的违纪或违法行为展开全面调查，收集充分证据（如书面材料、证人证言、监控记录等），确保事实清楚、证据确凿。此阶段需保证调查的客观性与合法性，避免程序瑕疵。

2. 内部审议与决定形成
   根据调查结果，单位应召开内部会议（如党组会、办公会等），依据《事业单位人事管理条例》《公务员法》等相关规定，审议是否达到除名条件（如连续旷工超15日、被依法追究刑事责任等）。决定需经集体讨论，形成书面记录，并由负责人签署意见。

3. 书面通知与送达
   单位需制作《除名决定书》，明确除名依据、事实及生效日期，并依法送达员工。送达方式包括直接送达、邮寄送达或公告送达（需确保员工已知悉）。若员工拒绝签收，可邀请第三方见证并留存证据。

4. 员工申诉与复核
   员工有权在收到决定后一定期限内（通常为30日）提出书面申诉。单位应成立复核小组，重新审查事实与程序，并在15日内出具复核意见。若维持原决定，需告知员工救济途径（如行政复议或诉讼）。

5. 档案与社保手续办理
   除名决定生效后，单位需将决定归入员工人事档案，并协助办理社保关系转移或终止手续，确保程序闭环。

注意事项：

• 除名与开除不同，前者适用于非严重违纪但需终止关系的情形，后者针对严重违法违纪。
  
• 程序瑕疵可能导致决定被撤销，单位需严格遵循每一步骤。
  
• 若涉及刑事犯罪，单位可依据《刑法》与人事管理规定并行处理。
  

如有具体案件细节或程序疑问，可直接向我咨询，我将结合案例进一步分析。