结论前置：企业破产重组自主经营期间欠工资，员工是可以起诉的。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国企业破产法》及相关司法解释，企业破产重组期间，虽然企业可能处于自主经营状态，但这并不免除其支付员工工资的义务。工资是员工劳动的直接回报，是企业必须承担的法定义务。因此，即使在企业破产重组自主经营期间，如果企业拖欠员工工资，员工仍然有权通过法律途径维护自己的合法权益。
二、起诉的法律依据与流程
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
- 《中华人民共和国企业破产法》及相关司法解释也明确了破产重组期间企业应支付员工工资的义务。
起诉流程：
- 准备证据：员工需要收集并整理好与工资支付相关的证据，如劳动合同、工资条、银行转账记录等。
- 提交起诉状：员工应向有管辖权的人民法院提交起诉状，明确诉讼请求、事实和理由。
- 法院受理与审理：法院在受理案件后，会依法进行审理，并作出判决。如果企业确实存在拖欠工资的行为，法院会判决企业支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
三、可能面临的法律后果
对于企业：
- 如果法院判决企业支付拖欠的工资，企业必须履行判决义务。否则，员工可以申请法院强制执行，法院有权采取查封、扣押、拍卖等措施来强制企业履行义务。
- 拖欠工资还可能影响企业的信用记录，对企业的融资、合作等产生负面影响。
对于员工：
- 如果员工成功起诉并获得法院判决支持，员工将能够获得拖欠的工资及可能的赔偿金。
- 员工在起诉过程中应积极配合法院的工作，提供必要的证据和协助，以确保自己的权益得到充分保障。
四、特殊情况与注意事项
破产重组计划的批准与执行：
- 在企业破产重组期间，如果重组计划已经获得法院批准并正在执行中，员工应关注重组计划的执行情况。如果重组计划中明确规定了工资支付的时间和方式，企业应按照重组计划执行。
- 如果重组计划未能得到有效执行，导致员工工资仍然被拖欠，员工仍然有权起诉企业。
与破产管理人的沟通：
- 在企业破产重组期间，破产管理人负责企业的日常管理和财产处置等工作。员工可以与破产管理人沟通，了解企业的财务状况和工资支付情况，并寻求破产管理人的帮助和支持。
建议：如果您或您身边的人遇到企业破产重组自主经营期间欠工资的情况，建议及时收集证据并咨询专业律师（即我，陈晓辉律师），以便更好地维护自己的合法权益。同时，也可以关注企业的破产重组进展和重组计划的执行情况，以便及时了解自己的工资支付情况。