在公安机关查处饭店刑事案件后，关于谁应该做出停业决定的问题，这主要取决于案件的具体情况以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：
若饭店涉及严重刑事犯罪，且可能继续危害公共安全或社会秩序：
- 在这种情况下，公安机关在侦查过程中，如果认为饭店的继续经营会对侦查工作造成妨碍，或者存在严重的安全隐患，可能会依据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对饭店采取临时性的查封、扣押等措施，这其中包括可能要求饭店停业。但这一决定通常是在紧急情况下，为了保障公共安全和社会秩序而作出的临时性措施。
- 此外，如果饭店的犯罪行为严重到足以构成吊销营业执照的法定情形，如涉及食品安全犯罪、非法经营罪等，相关行政机关（如市场监督管理局）在依法作出行政处罚时，可能会决定吊销饭店的营业执照，从而间接导致饭店停业。
若饭店的刑事犯罪情节较轻，或未直接涉及饭店经营活动的合法性：
- 在这种情况下，公安机关的查处行动可能主要针对犯罪嫌疑人个人，而不直接涉及饭店的停业问题。饭店的继续经营可能不受直接影响，除非犯罪嫌疑人是饭店的法定代表人或主要负责人，且其犯罪行为导致饭店无法正常运营（如被依法限制人身自由等）。
- 如果饭店因犯罪行为受到间接影响（如声誉受损导致客源减少），这属于市场行为范畴，应由饭店自行承担后果，并寻求合法途径恢复经营。
关于停业决定的法律程序和主体：
- 停业决定通常不是由公安机关直接作出的，除非是在紧急情况下为了保障公共安全和社会秩序而采取的临时性措施。在大多数情况下，停业决定可能由相关行政机关（如市场监督管理局、卫生健康委员会等）在依法履行职责过程中作出。
- 如果饭店因犯罪行为被依法吊销营业执照或受到其他行政处罚导致停业，这一决定将依据相关法律法规和行政程序作出，并会明确告知饭店停业的原因、期限和复业条件等。
法律建议：
- 对于饭店而言，如果因刑事案件受到查处并面临停业风险，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，以及可能的法律后果和应对策略。
- 饭店应积极配合公安机关的侦查工作，同时依法维护自身合法权益，如申请行政复议或提起行政诉讼等。
可能存在的法律后果：
- 如果饭店因犯罪行为被依法吊销营业执照或受到其他严重行政处罚，可能导致饭店无法继续经营，甚至面临破产清算等法律后果。
- 饭店的法定代表人或主要负责人可能因犯罪行为承担刑事责任，并可能受到行业禁入等限制。
总结来说，公安机关查处饭店刑事案件后，谁应该做出停业决定取决于案件的具体情况以及相关法律法规的规定。在大多数情况下，停业决定可能由相关行政机关在依法履行职责过程中作出。如果饭店面临停业风险，应及时咨询专业律师以了解自身权利和义务。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。