单位在产假期间先发了工资，之后又扣除生育津贴的做法是否合法，主要取决于单位是否为女职工缴纳了生育保险，以及生育津贴与女职工正常工资的比较情况。以下是对这一问题的详细分析：

1. 单位已缴纳生育保险的情况

   • 合法性分析：根据《女职工劳动保护特别规定》和《中华人民共和国社会保险法》，如果单位已经为女职工缴纳了生育保险，那么在产假期间，单位无需再向女职工支付原工资。相反，单位应凭女职工的生育凭证到生育保险基金处为其申请生育津贴，作为女职工产假期间的工资性补偿。因此，如果单位在产假期间先发了工资，之后又从工资中扣除了生育津贴，这种做法在法律上是不被直接禁止的，但关键在于扣除后的实际支付情况。
   • 生育津贴与工资的对比：若生育津贴等于或高于女职工正常出勤期间的工资，单位只需发放生育津贴即可，无需额外支付工资，也无需从已发工资中扣除生育津贴（因为生育津贴本身就是对工资的替代）。若生育津贴低于女职工正常出勤期间的工资，从保障女职工权益角度出发，单位理论上需要补足差额，确保女职工产假期间的实际收入不降低。如果单位在扣除生育津贴后，女职工的实际收入低于其正常出勤期间的工资，那么这种做法就是不合法的。

2. 单位未缴纳生育保险的情况

   • 不合法性分析：如果单位没有为女职工缴纳生育保险，那么根据《女职工劳动保护特别规定》，产假期间单位应当按照女职工产假前的工资标准支付工资。此时，如果单位先发了工资，之后又以生育津贴为由扣除，这种做法是不合法的，因为单位根本就没有资格领取生育津贴。

法律建议：

• 女职工在遭遇产假工资或生育津贴发放不合理的情况时，应首先尝试与单位进行友好协商，要求其按照法律规定处理。
• 如果协商不成，女职工可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能涉及的法律后果：

• 如果单位的行为违反了相关法律法规，劳动监察部门或劳动仲裁机构可能会责令单位改正，并可能对单位进行罚款等处罚。
• 女职工也有权要求单位支付其应得的工资和生育津贴差额，并可能获得相应的经济补偿。

综上所述，单位在产假期间先发了工资，之后又扣除生育津贴的做法是否合法，取决于多种因素。女职工应了解自己的权益，并在必要时采取合适的维权措施。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。