修公路占地以租代征是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律层面分析
违反《土地管理法》：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》，国家实施严格的土地用途管制制度，限制农用地转为建设用地。建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。以租代征的方式实质上是规避了这一法定程序，直接将农用地用于非农业建设，如修路等，明显违反了《土地管理法》的相关规定。
合同无效风险：
- 依据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。以租代征所签订的租赁合同，因违反土地管理法的强制性规范，存在被法院认定为无效合同的法律风险。这意味着合同双方均无法基于该合同获得法律保护，可能引发租金支付、土地使用等纠纷。
二、危害性分析
农民权益受损：
- 农民将土地出租后，若未获得合法保障，可能面临租金不稳定、土地难以复原及长期生活保障丧失等问题。一旦公路建设结束或运营不善，农民将面临生活困境。此外，以租代征给予农民的租金往往远低于法定的征地补偿标准，且租金的支付缺乏长期稳定性，当出现企业经营不善或租金拖欠等情况时，农民的经济利益将受到严重损害。
国家土地调控受影响：
- 以租代征导致大量农用地非法转为建设用地，破坏了土地利用总体规划，干扰了国家对土地市场的宏观调控，不利于土地资源的合理配置与长远发展。同时，这种行为还可能威胁国家的粮食安全，因为大量耕地被用于非农业建设，导致耕地数量减少，且非农业建设可能对耕地质量造成破坏。
三、特殊情况说明
- 在特定情况下，如临时用地需求（如材料堆放场、施工便道等），经过合法的审批程序，按照临时用地规定租用土地，并在使用期满后及时恢复土地原状归还农民，此类“租用”行为属于合法的临时用地行为，与“以租代征”有本质区别。但这种情况并不适用于修公路等长期占用土地的行为。
四、建议与对策
- 严格依法审批：修建公路应严格按照法律规定的程序和方式进行用地审批，确保项目的合法性。政府在进行修路等公共建设项目时，应依法进行农用地转用和土地征收审批，确保土地的合法使用。
- 公平合理补偿：若涉及土地征收，应按照相关法律法规的规定对农民进行公平合理的补偿，并与农民签订合法的征地补偿协议，保障农民的合法权益。
综上所述，修公路占地以租代征是不合法的，它不仅违反了我国的土地管理制度，还可能引发一系列社会问题与法律纠纷。因此，在涉及土地使用时，必须严格遵守相关法律法规，通过正规渠道进行申请与审批。若您在征地拆迁领域遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。