单位发绩效时书记和经理拿走一大半，这种做法是否合理，需要分情况讨论：
若公司有明确的绩效分配制度，且该制度经过合法程序制定并公示：
- 制度内容合法且合理：如果公司的绩效分配制度明确规定了不同职位或层级的员工在绩效分配中的比例，且这一比例是公平、合理的，同时该制度已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论）制定并公示，那么书记和经理按照制度拿走一大半绩效可能是合法的。但即便如此，这种分配方式也应当确保基层员工的绩效收入不低于当地最低工资标准，且整体分配应当体现出对员工工作成果的合理评价。
- 制度内容不合法或不合理：如果绩效分配制度存在违法或不合理之处，例如明显偏向管理层，忽视基层员工的贡献，或者分配比例严重失衡，那么这种分配方式就可能引发劳动纠纷。在这种情况下，员工有权向公司提出异议，甚至可以通过法律途径维护自己的合法权益。
若公司没有明确的绩效分配制度，或者制度未经合法程序制定并公示：
- 缺乏制度依据：在没有明确制度依据的情况下，公司随意将绩效的大部分分配给书记和经理，这种做法显然缺乏合理性。绩效分配应当基于员工的工作表现、贡献大小等因素进行，而不是由管理层单方面决定。
- 可能构成违法行为：如果公司的这种分配方式导致员工的绩效收入低于当地最低工资标准，或者违反了其他相关法律法规（如《劳动法》中关于工资分配的规定），那么这种行为就可能构成违法。员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的权益。
法律建议：
- 了解公司制度：首先，员工应当了解公司是否有明确的绩效分配制度，以及该制度的具体内容。如果制度存在违法或不合理之处，员工可以向公司提出修改建议。
- 收集证据：如果员工认为公司的绩效分配方式不合理或违法，应当收集相关证据（如工资条、绩效分配方案、公司制度等），以便在需要时证明自己的主张。
- 寻求法律帮助：如果员工与公司无法就绩效分配问题达成一致，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以根据具体情况为员工提供法律咨询和代理服务，帮助员工维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司行为合法且合理：员工可能需要接受公司的绩效分配方式，或者通过内部沟通机制表达自己的意见和建议。
- 如果公司行为违法或不合理：员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径要求公司改正违法行为，并可能获得相应的赔偿。
总之，单位发绩效时书记和经理拿走一大半是否合理，取决于公司是否有明确的、合法且合理的绩效分配制度。如果制度存在问题或缺乏制度依据，员工有权提出异议并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。