员工生病自动离职是否有经济补偿，需根据具体情况判断，关键在于离职的具体情形、用人单位是否存在过错，以及双方的协商结果。以下是对这一问题的详细分析：
一、无经济补偿的情况
- 主动辞职且无过错：
- 若员工单纯因自身疾病原因主动向用人单位提出离职，并且按照法律规定提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期内提前三日通知），同时用人单位不存在任何法定过错行为（如未拖欠工资、未未依法缴纳社保等），这种情况下通常没有经济补偿。因为主动辞职被视为员工基于自身意愿做出的决定，用人单位无需承担经济责任。
二、有经济补偿的情况
用人单位存在过错：
- 未提供劳动保护或条件：如工作场所存在安全隐患，影响员工健康，员工因此生病并主动离职。
- 未及时支付劳动报酬：长期拖欠工资，员工因经济压力生病并主动离职。
- 未依法缴纳社保：导致员工无法享受医疗等保险待遇，员工因此生病并主动离职。
- 规章制度违法：损害员工权益，如病假期间不发工资等，员工因此生病并主动离职。
- 在这些情况下，即便员工是因病主动辞职，也有权要求用人单位支付经济补偿。补偿标准按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
医疗期满后解除：
- 员工患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以解除劳动合同，但需提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资作为代通知金，并支付经济补偿。
协商一致解除：
- 如果员工与用人单位协商一致解除劳动合同，并且约定了经济补偿，那么用人单位需按照约定支付。
三、特殊补偿情况
医疗期工资：
- 员工在医疗期内，用人单位应当按照不低于本人正常工作时间工资的百分之六十支付病伤假期工资，但不得低于最低工资的百分之八十。
医疗补助费：
- 如果员工患病或者非因工负伤，经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作、也不能从事用人单位另行安排的工作而解除劳动合同的，用人单位除支付经济补偿外，还应发给不低于六个月工资的医疗补助费。患重病和绝症的，还应增加医疗补助费。
实例说明
以员工小张为例，他在职期间生病，发现公司一直未给他缴纳社保，导致他无法享受医疗待遇。于是，小张以公司未依法缴纳社保为由主动离职。在这种情况下，小张可以要求公司支付经济补偿。若小张在该公司工作了3年，那么公司应支付给他3个月工资作为经济补偿。
总结与建议：
员工生病自动离职是否有经济补偿，不能一概而论。在实际操作中，建议员工和用人单位充分沟通，明确各自的权利和义务。如果员工认为用人单位存在过错导致自己生病并主动离职，可以收集相关证据（如工资条、社保缴纳记录、医疗证明等），向用人单位提出经济补偿要求。如果双方无法协商一致，员工可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。