公司补缴社保后要求撤诉是否合法需分情况讨论，具体如下：

1. 若撤诉是双方协商一致的结果
   根据《民事诉讼法》第十三条，当事人有权在法律规定的范围内处分自己的民事权利和诉讼权利。若您与公司就社保补缴问题达成和解，公司补缴后您自愿撤诉，属于合法处分自身权利的行为。此时需注意：

   • 需签订书面和解协议，明确补缴金额、时间、撤诉承诺等条款，避免口头约定引发后续纠纷；
     
   • 撤诉需通过法院或仲裁机构正式办理，口头同意撤诉但未完成程序仍可能继续审理。

2. 若公司以补缴为条件强制要求撤诉
   若公司未与您协商，单方面以“不补缴则不撤诉”或“补缴后必须撤诉”等条件施压，可能涉嫌违法：

   • 社保补缴是公司的法定义务（《社会保险法》第六十条），不得以撤诉作为履行义务的前提；
     
   • 若您因公司威胁、胁迫而撤诉，可依据《民事诉讼法》第二百零八条申请再审，或通过劳动监察部门投诉公司违法行为。

3. 撤诉后能否再次主张权利

   • 劳动仲裁阶段：撤诉后原则上不得以同一事实和理由再次申请仲裁（《劳动人事争议仲裁办案规则》第三十五条），但若能证明撤诉非自愿（如受胁迫），可申请恢复审理；
     
   • 诉讼阶段：原告撤诉后，若未在六个月内以同一事实和理由重新起诉，法院通常不予受理（《民事诉讼法》第一百四十七条）。

建议行动：

• 若您同意撤诉，务必要求公司出具书面补缴证明，并留存社保缴费记录作为证据；
  
• 若公司拒绝补缴或您对撤诉后果存疑，可直接向我咨询具体应对方案，我会结合您的案件细节提供法律指导。