结论：单位因档案丢失而拒绝为员工开具证明以查询工资单，这一行为可能违法，具体取决于单位是否有义务提供该证明以及档案丢失与开具证明之间的直接关联性。
分析：
单位是否有义务提供工资单证明：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工有权了解自己的工资构成和发放情况，单位也有义务提供相应的工资单或相关证明。这是员工的基本权益之一，也是单位应尽的义务。
- 如果单位拒绝提供工资单证明，且没有合理的理由，那么这一行为可能构成对员工权益的侵犯。
档案丢失与开具证明的关系：
- 档案丢失本身并不直接决定单位是否应开具工资单证明。档案的丢失可能是一个管理上的失误，但它不应成为单位拒绝履行其法定义务的理由。
- 如果单位因档案丢失而无法直接提供工资单，它应尝试通过其他方式（如电子记录、备份文件等）来证明员工的工资情况，而不是简单地拒绝开具证明。
可能的法律后果：
- 如果单位因档案丢失而拒绝开具工资单证明，且这一行为被认定为违法，那么单位可能面临劳动行政部门的处罚，如警告、罚款等。
- 同时，员工也有权向劳动争议仲裁委员会或法院提起诉讼，要求单位履行其义务并赔偿因拒绝开具证明而造成的损失。
建议：
- 对于员工：如果单位因档案丢失而拒绝开具工资单证明，你可以首先与单位进行沟通，要求其通过其他方式提供证明。如果沟通无果，你可以向当地的劳动行政部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，以维护自己的合法权益。
- 对于单位：应加强档案管理，确保员工档案的完整性和安全性。如果因特殊原因导致档案丢失，应积极采取措施补救，并尽力通过其他方式提供员工所需的证明，以避免不必要的法律纠纷。
额外思考：
- 在实际操作中，单位可能会以各种理由拒绝开具工资单证明，如“档案丢失无法查找”、“系统故障无法打印”等。对于这些理由，员工应要求单位提供具体的证据或说明，并评估其合理性。
- 如果单位确实无法提供工资单证明，员工可以尝试通过其他途径获取自己的工资信息，如查看银行流水记录、与同事核对等。但这些方法可能存在一定的局限性，因此最好还是通过法律途径来维护自己的权益。
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