结论：离职后发现公司少申报个税和多代扣个税，不可以直接向法院提起诉讼，而应先向税务机关进行投诉举报，由税务机关依法处理。若对税务机关的处理结果不服，再考虑通过行政复议或行政诉讼等途径解决。
详细分析：
税务争议的处理途径：
- 根据我国税收征收管理法的相关规定，税务争议通常应先通过税务机关的行政程序解决。这包括向税务机关进行投诉举报，由税务机关依法进行调查、核实，并作出相应的处理决定。
- 在您的情况下，发现公司少申报个税和多代扣个税，这属于税务违法行为，您应首先向当地税务机关进行投诉举报，提供相关证据材料，如工资条、个税申报记录等，以便税务机关进行调查核实。
税务机关的处理程序：
- 税务机关在接到您的投诉举报后，会依法进行调查，核实公司的税务违法行为，并根据调查结果作出相应的处理决定，如补缴税款、加收滞纳金、罚款等。
- 如果您对税务机关的处理决定不服，可以在规定的时间内申请行政复议，对行政复议结果仍不服的，再向人民法院提起行政诉讼。
直接向法院提起诉讼的不可行性：
- 在税务争议中，直接向法院提起诉讼通常不是首选途径。因为税务争议往往涉及复杂的税收法律法规和税务专业知识，需要由税务机关先进行行政处理，以确保争议的公正、高效解决。
- 如果未经税务机关行政处理而直接向法院提起诉讼，法院可能会以“未经过行政复议前置程序”或“不属于法院直接受理范围”等理由驳回起诉。
建议与行动：
- 收集证据：在向税务机关投诉举报前，建议您先收集好相关证据材料，如工资条、个税申报记录、劳动合同等，以便证明公司的税务违法行为。
- 及时投诉举报：一旦发现公司存在少申报个税和多代扣个税的情况，应尽快向当地税务机关进行投诉举报，以免错过最佳时机。
- 关注处理结果：在税务机关处理过程中，您应保持关注，及时了解处理进展和结果。如果对处理结果不服，可以在规定的时间内申请行政复议或提起行政诉讼。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律支持。