结论：车辆登记在小三名下但实际由男方使用，起诉是否有用需视具体情况而定，主要取决于起诉的目的和所依据的法律事实。以下从不同角度进行分析：
一、若起诉目的是要求返还车辆
若车辆为夫妻共同财产：
- 法律背景：根据《民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，归夫妻共同所有。若车辆是在婚姻关系存续期间购买，且未明确约定为个人财产，则应视为夫妻共同财产。
- 法律建议：若男方未经女方同意，擅自将夫妻共同财产赠与小三，女方可以起诉要求确认赠与行为无效，并要求小三返还车辆。在此情况下，起诉是有用的，且女方有较大可能性获得法院支持。
若车辆为男方个人财产：
- 法律背景：若车辆是男方在婚前购买，或婚后明确约定为个人财产，则车辆归男方个人所有。
- 法律建议：在此情况下，男方有权自由处分自己的财产，包括赠与小三。女方若想起诉要求返还车辆，将面临较大法律障碍，除非能证明男方赠与行为存在恶意或违反公序良俗等情形。但这种情况下的起诉，成功可能性相对较低。
二、若起诉目的是要求确认车辆归属或处理相关纠纷
- 法律背景：无论车辆是否为夫妻共同财产，若因车辆归属或使用产生纠纷，如男方与小三之间就车辆产生争议，或车辆涉及交通事故等法律责任问题，均可通过法律途径解决。
- 法律建议：在此情况下，起诉的目的可能是确认车辆的实际归属、划分责任等。起诉是否有用，取决于具体纠纷的性质、证据的充分性以及法院的裁判标准。若证据充分、事实清楚，起诉是解决纠纷的有效途径。
三、实际操作中的注意事项
- 收集证据：无论起诉目的是什么，收集证据都是关键。包括但不限于购车合同、付款凭证、车辆登记证书、男方与小三的聊天记录或录音等，以证明车辆的实际购买情况、归属以及男方的赠与行为等。
- 咨询专业律师：由于法律问题的复杂性，建议在起诉前咨询专业律师，对案件进行全面评估，制定合适的诉讼策略。
- 考虑诉讼成本：起诉需要投入时间、精力和金钱，包括诉讼费、律师费等。在决定起诉前，应充分考虑诉讼成本与预期收益之间的平衡。
总结与建议：车辆登记在小三名下但实际由男方使用，起诉是否有用需根据具体情况判断。若车辆为夫妻共同财产且男方未经同意赠与小三，女方起诉要求返还车辆有较大可能性获得支持；若车辆为男方个人财产或起诉目的涉及其他纠纷，则需根据具体情况评估起诉的可行性和成功率。在决定起诉前，建议收集充分证据并咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。