结论前置：公司无法开具发票，甲方以此为由拒绝付款是否违法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若合同明确约定以开具发票为付款前提条件
   根据《民法典》第五百二十六条，若合同中明确约定“乙方开具发票后，甲方支付款项”，则开具发票属于先履行义务。此时若公司未开具发票，甲方有权行使先履行抗辩权，拒绝付款且不构成违约。但需注意：

   • 合同条款需明确约定“先票后款”，若仅笼统约定“乙方需提供发票”，可能被认定为非主要义务，甲方拒绝付款可能被认定为违约；
     
   • 若公司已开具发票但因客观原因（如发票遗失、税务系统故障）无法交付，甲方不得以此为由拒绝付款，可要求公司补开或提供其他证明。

2. 若合同未约定发票与付款的先后顺序
   根据《民法典》第五百七十七条，付款是甲方的主合同义务，开具发票是公司的附随义务。附随义务未履行不影响主合同义务的履行，因此甲方不得仅以公司未开具发票为由拒绝付款。但甲方可同时主张：

   • 要求公司开具发票（若公司拒不开具，可向税务机关举报）；
     
   • 在付款后通过法律途径（如起诉）要求公司补开发票或赔偿因无法抵扣税款造成的损失。

3. 若公司存在偷逃税等违法行为导致无法开票
   若公司因未依法纳税、未办理税务登记等违法行为导致无法开具发票，甲方除可拒绝付款外，还可向税务机关举报公司违法行为，并要求公司承担违约责任（如赔偿损失、支付违约金等）。此时甲方的拒绝付款行为具有合法性，且公司可能面临行政处罚（如罚款、停业整顿）甚至刑事责任。

建议：

• 对公司而言，应优先履行开票义务，若因客观原因无法开票，需及时与甲方沟通并提供替代方案（如补开、提供税务证明）；
  
• 对甲方而言，若公司未开票，可先书面催告并留存证据，再决定是否拒绝付款，避免因单方拒付构成违约。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供更精准的法律分析。