结论前置：合同跟总公司签的，结算款能否支付给子公司，这主要取决于合同的具体约定、总公司的授权情况以及是否符合相关法律法规的要求。在合法合规、双方协商一致且合同中有明确约定或总公司有明确授权的情况下，结算款是可以支付给子公司的。

法律背景与详细分析

1. 合同约定的重要性

   • 明确付款对象：合同是双方权利义务的法律依据，其中应明确注明款项的支付对象。如果合同中明确规定付款对象为总公司，那么原则上结算款应支付给总公司，不得擅自变更支付对象。但如果合同中允许或约定了可以将款项支付给子公司，或者通过补充协议等方式明确了这一点，那么支付给子公司就是合法的。
   • 诉讼主体明确：即便款项支付给子公司，合同的诉讼主体仍应为总公司，因为子公司并非合同的直接签订方，这有助于确保法律责任的清晰和可追溯性。

2. 总公司的授权情况

   • 书面授权：如果总公司通过书面授权等明确方式，允许子公司代收合同款项，那么付款方可以按照授权将款项支付给子公司。这种授权应当明确、具体，并符合总公司的内部决策程序。
   • 内部决策程序：总公司应建立严格的内部决策程序，对授权子公司代收款项等事项进行审查批准，确保授权的合法性和合规性。

3. 法律法规的遵循

   • 合法性基础：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，分公司作为总公司的分支机构，虽不具有独立法人资格，但在一定范围内可以开展民事活动并涉及资金往来。这为总公司与子公司之间的资金调拨提供了一定的法律基础。
   • 合规性要求：在支付款项时，应确保款项的合法性和合规性，遵守相关税收法规、财务管理制度以及反洗钱等法律法规的规定。同时，应仔细核对账户信息，确保资金安全，避免发生资金挪用、诈骗等风险事件。

实际操作建议

1. 充分协商：签订合同的双方应就款项支付事宜进行充分协商，确保双方对支付方式、金额、时间等关键条款达成一致。如果需要将款项支付给子公司，应在合同中明确约定或通过补充协议等方式进行明确。

2. 审批流程：总公司应建立严格的审批流程，对子公司提交的合同及付款申请进行审查批准。审查内容包括但不限于合同的合法性、合规性、付款对象的明确性以及子公司代收款项的授权情况等。

3. 财务管理制度：子公司应建立完善的财务管理制度，确保接收到的款项用于合法合规的用途，并定期向总公司报告财务状况和运营情况。这有助于总公司对子公司的财务状况进行监督和管理，确保资金的安全和合规使用。

风险提示

1. 合规性风险：如果未经总公司授权或违反合同约定将款项支付给子公司，可能构成违约或违法行为，面临法律责任和声誉损失等风险。

2. 资金安全风险：在转账支付过程中，应仔细核对账户信息，确保资金安全。如果因账户信息错误或诈骗等原因导致资金损失，将难以追回。

综上所述，合同跟总公司签的结算款能否支付给子公司，需要综合考虑合同约定、总公司的授权情况以及法律法规的要求。在确保合法合规、双方协商一致并建立了完善的财务管理制度的前提下，可以将款项支付给子公司。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。