在提成制公司中，怀孕期间请病假，工资是否要扣，需分情况讨论：

一、病假工资的基本规定

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》等相关法律法规，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。这是病假工资的基本支付原则，适用于所有企业，包括提成制公司。

二、提成制公司工资构成的特殊性

提成制公司的工资构成通常包括基本工资和提成两部分。基本工资是固定的，而提成则与员工的业绩直接相关。在怀孕期间请病假的情况下，员工可能无法正常工作，从而影响其业绩，进而影响提成部分。然而，这并不意味着公司可以随意扣除员工的病假工资。

三、提成制公司怀孕期间请病假工资的具体处理

1. 基本工资部分：

   • 根据前述病假工资的基本规定，员工在病假期间，公司应至少支付其基本工资（如果基本工资高于当地最低工资标准的80%）。如果基本工资低于当地最低工资标准的80%，则公司应按最低工资标准的80%支付。

2. 提成部分：

   • 提成部分的处理则相对复杂。由于提成与业绩直接相关，而病假期间员工无法正常工作，因此提成部分可能会受到影响。但是，这并不意味着公司可以完全扣除提成。公司应根据员工的实际工作情况、业绩贡献以及公司政策等因素，合理确定提成部分的支付方式。
   • 如果公司政策或劳动合同中有明确规定病假期间提成的支付方式，则应按照规定执行。如果没有明确规定，则公司应与员工进行协商，达成一致意见。

四、特殊情况下的处理

• 如果员工在怀孕期间因病情严重需要长期病假，且该病情与怀孕直接相关（如妊娠并发症等），则公司应更加人性化地处理工资问题。在这种情况下，公司可以考虑给予员工更多的关怀和支持，如适当提高病假工资标准、提供额外的医疗补助等。
• 如果公司违反相关规定扣除员工病假工资，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

总结与建议：

在提成制公司中，怀孕期间请病假，工资是否要扣需根据具体情况来判断。基本工资部分应按照病假工资的基本规定支付；提成部分则应根据员工的实际工作情况、业绩贡献以及公司政策等因素合理确定。如果公司政策或劳动合同中有明确规定，则应按照规定执行；如果没有明确规定，则应与员工进行协商。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。