员工出差开车撞到石头上的赔偿问题，需根据具体情况判断责任归属及赔偿方式，核心结论如下：

1. 若员工因个人疏忽或违规驾驶导致事故

   • 责任主体：员工需承担主要或全部责任。根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益的，应承担侵权责任。若员工未遵守交通规则（如超速、疲劳驾驶）或未尽合理注意义务（如未观察路况），导致车辆撞到石头，通常需自行承担车辆维修费用及可能产生的第三方损失。
     
   • 赔偿方式：
     
     • 若员工驾驶自有车辆出差，且公司未要求使用私车，赔偿由员工自行承担；
       
     • 若员工驾驶公司车辆，公司可依据内部规章制度（如《车辆管理制度》）要求员工赔偿部分或全部损失，但需证明员工存在重大过失或故意行为。
       

2. 若事故因不可抗力或第三方原因导致

   • 责任主体：若事故由不可抗力（如突发自然灾害、道路塌陷）或第三方行为（如其他车辆遗撒石块）导致，员工无过错时，责任可能由第三方或保险公司承担。
     
   • 赔偿方式：
     
     • 车辆保险：若员工或公司为车辆投保了车损险、第三者责任险等，可向保险公司申请理赔；
       
     • 第三方追责：若能证明事故由第三方行为导致（如道路养护单位未及时清理障碍物），可向第三方主张赔偿。
       

3. 若公司未履行安全保障义务

   • 责任主体：若公司未提供符合安全标准的车辆（如未定期检修）、未明确出差驾驶规范（如强制连续驾驶超时），或未为员工购买必要保险，可能需承担部分责任。
     
   • 赔偿方式：根据《安全生产法》第4条，公司有义务保障员工劳动安全。若因公司过错导致事故，员工可要求公司承担医疗费、误工费等损失，具体比例需结合过错程度认定。
     

行动建议：

• 员工应立即报警并保留事故现场证据（如照片、视频、交警认定书）；
  
• 及时通知公司及保险公司，按流程报案并提交理赔材料；
  
• 若对责任认定有争议，可委托第三方机构（如鉴定中心）进行事故原因分析；
  
• 涉及复杂责任划分或大额赔偿时，建议通过法律途径解决。
  

如有进一步细节（如事故地点、车辆归属、保险情况等），可向我补充说明，以便更精准分析。