结论：农民工保证金直接交给发包方是否合法需分情况讨论，关键取决于保证金性质、合同约定及地方性法规要求，以下为具体分析：

1. 若保证金性质为“工资保证金”且符合地方性法规要求，发包方代收可能合法
   根据《保障农民工工资支付条例》第三十二条，施工总承包单位需按工程合同约定，在银行开设农民工工资专用账户，专项用于支付农民工工资。部分地方性法规（如《XX省工程建设领域农民工工资保证金实施办法》）可能允许发包方代收保证金，但需满足两个条件：

   • 发包方与总承包单位在合同中明确约定由发包方代收，且代收后需在2个工作日内将保证金存入专用账户；
     
   • 代收行为需向当地人社部门备案，并接受监管。
     若未满足上述条件，发包方直接收取保证金可能涉嫌违法，农民工可要求总承包单位直接开设专用账户，或向当地劳动监察部门投诉。

2. 若保证金性质为“履约保证金”或“质量保证金”，发包方收取需严格依据合同约定
   根据《民法典》第四百七十条，合同双方可约定“履约保证金”或“质量保证金”条款，但需明确：

   • 保证金金额不得超过工程价款结算总额的3%（依据《建设工程质量保证金管理办法》第七条）；
     
   • 保证金需在工程竣工验收合格后28日内返还（同上条）；
     
   • 若合同未约定发包方收取保证金，或约定违反上述比例、返还期限，发包方强行收取可能构成违约，农民工可要求返还或通过诉讼解决。

3. 若发包方以“保证金”名义变相扣押工资，直接违法
   根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条，任何单位和个人不得以任何理由扣押农民工工资。若发包方以“保证金”名义扣押工资，或要求农民工将工资转入非专用账户，均属违法行为，农民工可向当地劳动监察部门举报，要求发包方立即返还并支付工资。

建议行动：

• 若您遇到发包方收取保证金的情况，首先要求对方出示书面合同条款及地方性法规依据；
  
• 若无法提供，或收取方式涉嫌违法，可向当地劳动监察大队投诉（电话：12333），或通过劳动仲裁主张权利；
  
• 若涉及金额较大或情况复杂，可整理合同、转账记录等证据，直接向我咨询具体维权方案。