管辖权异议申请通过后，案件是会直接移交的。具体分析如下：
一、法律依据与程序
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。人民法院对当事人提出的异议，会进行审查。如果异议成立，即受诉法院确实没有管辖权，那么法院会裁定将案件移送至有管辖权的人民法院。这一裁定具有法律效力，原受诉法院应将案件的全部案卷材料移送至被移送的有管辖权的人民法院，并通知双方当事人。
二、移交的条件与具体流程
提出异议：当事人认为受诉法院无管辖权时，应在提交答辩状期间（通常为收到起诉状副本之日起15日内）向受诉法院提出管辖权异议申请。
审查异议：受诉法院会对当事人提出的管辖权异议进行审查。审查过程中，法院会综合考虑案件的性质、标的额大小、影响范围等因素，以及相关法律法规的规定，以确定受诉法院是否具有管辖权。
作出裁定：如果法院认为异议成立，即受诉法院确实没有管辖权，那么法院会作出移送管辖的裁定。如果异议不成立，则裁定驳回当事人的异议申请。
执行裁定：一旦法院作出移送管辖的裁定，原受诉法院应立即执行，将案件的全部案卷材料移送至被移送的有管辖权的人民法院，并通知双方当事人。这一过程中，案件的移交是直接且明确的，不存在中间环节或额外的程序。
三、注意事项
及时提出异议：当事人必须在法定的期限内提出管辖权异议，否则可能被视为放弃异议权利，导致案件继续在原受诉法院审理。
提供充分证据：当事人在提出管辖权异议时，应提供充分的证据来支持其主张，如证明被告住所地、合同履行地等与管辖权相关的事实。这些证据将有助于法院更准确地判断管辖权问题。
遵守法律程序：在整个管辖权异议的处理过程中，当事人应严格遵守法律程序，不得采取不正当手段干扰法院的审查工作。否则，可能会面临法律制裁或导致异议申请被驳回。
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