在基本事实不清的情况下更换法院审理，法院的判决会因案件所处的诉讼阶段及新法院对事实的认定情况而有所不同。以下从不同角度进行详细分析：
一、一审阶段基本事实不清，更换法院（如管辖权转移或指定管辖）后的判决
若新法院认为事实仍无法查清：
- 判决结果：新法院可能会依据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，以事实不清、证据不足为由，判决驳回原告诉讼请求，或者根据现有证据和法律规定，作出对一方不利的判决（但这种判决可能因事实不清而面临上诉被改判的风险）。
- 法律依据：根据《民事诉讼法》及相关司法解释，法院在审理案件时，必须以事实为依据，以法律为准绳。若事实无法查清，法院无法作出公正、合理的判决。
若新法院通过进一步调查取证，查清了事实：
- 判决结果：新法院将根据查清的事实和法律规定，作出公正、合理的判决。
- 法律依据：法院有权依职权调查取证，以查明案件事实。在查清事实的基础上，法院将依法作出判决。
二、二审阶段因事实不清发回重审，更换法院（如原审法院重新组成合议庭或上级法院指定其他法院审理）后的判决
若重审法院仍认为事实不清：
- 判决结果：重审法院可能会再次以事实不清、证据不足为由，判决驳回原告诉讼请求，或者根据现有证据和法律规定，尝试作出判决（但同样可能面临再次上诉被改判的风险）。不过，在实务中，重审法院通常会更加谨慎地处理案件，尽力查清事实。
- 法律依据：二审法院发回重审的案件，重审法院应当按照二审法院的指导意见，重新审理案件。若仍无法查清事实，重审法院需根据法律规定作出相应处理。
若重审法院查清了事实：
- 判决结果：重审法院将根据查清的事实和法律规定，作出新的判决。该判决将取代原一审判决，成为生效判决（除非当事人再次上诉）。
- 法律依据：重审法院在查清事实的基础上，有权依法作出判决。该判决具有法律效力，当事人应当履行。
三、特殊情况下的处理
- 当事人申请回避或法院依职权回避：若因当事人申请回避或法院依职权回避导致更换合议庭成员或审理法院，但案件事实已经查清的，新法院或新合议庭将直接依据查清的事实和法律规定作出判决。
- 诉讼中止与恢复：若在诉讼过程中，因出现法定中止情形（如当事人死亡、需要等待另一案结果等）导致诉讼中止，后恢复诉讼时可能因原合议庭成员变更或审理法院变更而“更换法院”（此处“更换法院”更多指合议庭成员变更，但原理相似）。在此情况下，新合议庭将依据中止前已查清的事实和恢复诉讼后新查明的事实，共同作出判决。
建议：在面临基本事实不清的诉讼时，当事人应积极配合法院调查取证，提供尽可能多的证据材料以支持自己的主张。同时，若对法院的判决有异议，应及时行使上诉权或申请再审权，以维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。