中标候选人只有两家，在特定情况下是合法的。以下是对此问题的详细分析：

合法性分析

1. 招标文件规定：

   • 招标文件是招标活动的法律性文件，其中会明确规定中标候选人的数量。如果招标文件规定中标候选人可以为两家，那么在这种情况下，只有两家中标候选人是合法的。

2. 投标人数不足：

   • 在招标过程中，如果投标人数不足三家，但招标文件并未因此废标，而是继续评标并确定中标候选人，那么在这种情况下，中标候选人可能只有两家或更少。这种情况下的合法性取决于招标文件的具体规定以及相关法律法规的适用。例如，根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，在投标人少于三个的情况下，招标人应当依照本法重新招标，但也有例外情形，如国有资金占控股或者主导地位的依法必须进行招标的项目，招标人应当确定排名第一的中标候选人为中标人。排名第一的中标候选人放弃中标、因不可抗力不能履行合同、不按照招标文件要求提交履约保证金，或者被查实存在影响中标结果的违法行为等情形，不符合中标条件的，招标人可以按照评标委员会提出的中标候选人名单排序依次确定其他中标候选人为中标人，也可以重新招标。若在此流程中，仅剩两家符合条件，则两家中标候选人亦为合法。

3. 评标过程结果：

   • 评标过程是确定中标候选人的关键环节。如果评标委员会在评标过程中，发现只有两家投标人的投标文件符合招标文件的要求，那么评标委员会可以推荐这两家投标人为中标候选人。这种情况下的合法性同样取决于招标文件的具体规定以及评标过程的公正性和合规性。

注意事项

• 招标文件的重要性：招标文件是招标活动的基石，所有招标活动都应严格按照招标文件的规定进行。因此，在确定中标候选人数量时，应首先查阅招标文件的相关规定。
• 法律法规的适用：在招标过程中，应严格遵守相关法律法规的规定。如果法律法规对中标候选人的数量有明确规定，那么应按照法律法规的规定执行。
• 评标过程的公正性：评标过程应公正、公平、公开，确保所有投标人的权益得到保障。评标委员会应严格按照招标文件的规定和评标标准进行评标，确保评标结果的合法性和公正性。

若您在招标过程中遇到任何法律问题或疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。