结论：公司同意项目部卖废钢筋，费用由项目部支配是否合法，需结合公司内部规章制度、授权情况以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司内部规章制度与授权情况
公司规章制度：
- 若公司内部有明确的规章制度，规定项目部有权处理废旧物资（包括废钢筋）并支配相关费用，且该制度符合法律法规要求，那么项目部的行为是合法的。
- 若公司规章制度未明确规定或规定不明确，则需要进一步分析公司对项目部的授权情况。
公司授权：
- 如果公司以书面形式明确授权项目部处理废旧物资并支配费用，且该授权未违反法律法规和公司章程，那么项目部的行为是合法的。
- 若公司未明确授权或授权不明确，项目部擅自处理废旧物资并支配费用，则可能构成越权行为，其合法性存疑。
二、相关法律法规
公司法相关规定：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司应当建立健全内部管理制度，明确各部门职责和权限。项目部作为公司的内部机构，其行为应当符合公司规章制度和法律法规要求。
- 若项目部行为超出公司授权范围或违反法律法规，公司有权追究项目部相关责任人的法律责任。
物权法相关规定：
- 废钢筋作为公司的财产，其所有权归公司所有。项目部在处理废旧物资时，应当确保公司财产的安全和完整，不得擅自处置或侵占。
- 若项目部擅自处置废旧物资并支配费用，可能构成对公司财产权的侵害，公司有权要求项目部返还相关费用并承担赔偿责任。
三、合法性判断与建议
合法性判断：
- 在公司规章制度明确且授权合法的前提下，项目部卖废钢筋并支配费用的行为是合法的。
- 若公司规章制度不明确或未授权，项目部行为可能构成越权或侵权，其合法性存疑。
建议：
- 对于公司：建议公司完善内部管理制度，明确各部门职责和权限，特别是关于废旧物资处理和费用支配的规定。同时，加强对项目部的监督和管理，确保其行为符合公司规章制度和法律法规要求。
- 对于项目部：在处理废旧物资前，应确保获得公司的明确授权，并严格按照公司规章制度和法律法规要求进行操作。若对公司规章制度或授权存在疑问，应及时向公司相关部门咨询并确认。
总结：公司同意项目部卖废钢筋，费用由项目部支配是否合法，需结合公司内部规章制度、授权情况以及相关法律法规综合判断。若公司规章制度明确且授权合法，则项目部行为合法；若规章制度不明确或未授权，则项目部行为可能构成越权或侵权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。