结论前置：法律并未明确规定棋牌室不能在小区底商开设，但其合法性取决于多个因素，包括是否取得合法证照、经营内容是否合规、是否影响居民正常生活以及房屋使用性质等。以下是对这些因素的详细分析：
证照齐全：
- 棋牌室在开设前，必须依法办理营业执照、卫生许可证等相关证件，并确保这些证件在有效期内。这是合法经营的基础条件，也是市场监督管理部门对商业活动进行监管的重要依据。若未办理相关执照和许可证，私自经营棋牌室，则属于无证经营的违法行为，将面临市场监督管理等部门的查处。
经营内容合规：
- 棋牌室应仅提供一般的娱乐活动，如家庭或朋友间的聚会娱乐，并收取合理的管理费用。若以营利为目的，涉嫌开设赌局或容留赌博行为，则构成严重的违法行为。根据《治安管理处罚法》的相关规定，以营利为目的为赌博提供条件的，将受到相应的治安处罚，甚至可能追究刑事责任。
不影响居民正常生活：
- 棋牌室在经营过程中，应严格遵守营业时间规定，避免产生噪音、人员嘈杂等问题，以免影响周围居民的正常生活。若经营过程中产生噪音、人员嘈杂等问题严重影响到周围居民的正常生活休息，受影响的居民有权向相关部门投诉并要求整改。
房屋使用性质合规：
- 棋牌室设在小区底商时，需确保房屋的使用性质符合相关规定。若底商原本即为商业用途，则开设棋牌室通常无需额外审批。但若底商原本为住宅用途，则需经过有利害关系的业主一致同意，并将住宅改变为经营性用房，同时符合相关部门的管理规定，方可开设棋牌室。未经同意私自改变房屋性质，将构成违法行为。
法律建议：
- 在开设棋牌室前，建议经营者充分了解相关法律法规和政策要求，确保所有证照齐全且有效。
- 经营过程中，应严格遵守法律法规，避免涉及任何形式的赌博行为，并确保经营内容合规。
- 加强与周围邻居的沟通，了解他们的意见和需求，尽量避免产生噪音、人员混杂等问题，以维护邻里和谐。
- 定期进行自查自纠工作，及时发现并解决存在的问题，确保持续合规经营。
若您在开设棋牌室过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。