关于在小区内开设棋牌室的合法性问题，这确实是一个需要综合考虑多方面因素的问题。以下是我为您详细分析的内容：
一、合法经营的前提条件
证照齐全：首先，棋牌室必须依法办理相关的营业执照、卫生许可证等证件，并确保这些证件在有效期内。这是合法经营的基础，也是市场监管部门对商业活动进行监管的重要依据。
娱乐性质为主：棋牌室应主要提供娱乐活动，如家庭或朋友间的聚会娱乐，并收取合理的管理费用。重要的是，要避免涉及任何形式的赌博行为，因为赌博是违法的，并会带来严重的法律后果。
遵守法律法规：在经营过程中，棋牌室必须严格遵守《民法典》、《个体工商户条例》等相关法律法规，确保经营活动的合法性。同时，还应遵守营业时间规定，避免产生噪音、人员嘈杂等问题，以免影响周围居民的正常生活。
房屋使用性质合规：如果棋牌室设在商业配套区域，或者经过有利害关系的业主一致同意将住宅改变为经营性用房，并且符合相关部门的管理规定，那么房屋使用性质是合规的。但未经同意私自改变房屋性质是违法的。
二、非法经营的情况
无证经营：若未办理相关执照和许可证，私自经营棋牌室，则属于无证经营的违法行为。这种情况下面临市场监管等部门的查处风险极高。
涉嫌赌博：如果棋牌室以营利为目的，涉嫌开设赌局或容留赌博行为，那么这是严重的违法行为。根据《治安管理处罚法》的相关规定，以营利为目的为赌博提供条件的或将受到相应的治安处罚甚至刑事责任追究。
扰民问题：即便取得了合法证照，但如果棋牌室经营过程中产生噪音、人员嘈杂等问题严重影响到周围居民的正常生活休息，这也是不被允许的。受影响的居民有权向相关部门投诉并要求整改。
三、实际案例与处理
以您提供的案例为例，平房区和苑小区居民楼里无照经营麻将馆，在居民楼里面严重影响居民生活。经相关部门调查，该经营地点为棋牌室，未发现存在赌博行为，但没有营业执照。因此，依据市场主体登记管理条例实施细则下达了《责令改正通知书》，要求其停止经营，取得经营手续后方可营业。同时，关于其噪音扰民问题，也要求经营者采取增设隔音设备等方式，不得影响居民正常生活秩序。
四、建议与注意事项
加强邻里沟通：在开设棋牌室前，应与周围邻居进行充分沟通，了解他们的意见和需求，尽量避免产生噪音、人员混杂等问题，以免影响邻里和谐。
合规经营意识：经营者应具备强烈的合规经营意识，严格遵守相关法律法规和规章制度，确保经营活动的合法性。
定期自查自纠：棋牌室应定期进行自查自纠工作，及时发现并解决存在的问题，以确保持续合规经营。
综上所述，小区内开设棋牌室的合法性是一个综合考量的问题。只有在满足所有相关法律规定的前提下，才能确保经营活动的合法性。因此，我建议您在开设棋牌室前，应充分了解相关法律法规和政策要求，并严格按照规定进行操作，以确保经营活动的顺利进行。