仲裁条款在合同无原件的情况下，其有效性需分情况讨论：

1. 仲裁条款独立存在且内容明确：

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条：“仲裁协议包括合同中订立的仲裁条款和以其他书面方式在纠纷发生前或者纠纷发生后达成的请求仲裁的协议。仲裁协议应当具有下列内容：（一）请求仲裁的意思表示；（二）仲裁事项；（三）选定的仲裁委员会。” 若仲裁条款本身独立存在，且内容明确，包含了上述法定要素，即便合同原件缺失，该仲裁条款仍然有效。因为仲裁条款的效力并不完全依赖于合同原件的存在，而是取决于其自身的合法性和明确性。

2. 仲裁条款作为合同一部分且合同无原件：

   • 若仲裁条款是作为合同的一部分，而合同整体无原件，此时仲裁条款的效力会受到一定影响。但关键在于，能否通过其他证据（如合同复印件、电子邮件、传真件、聊天记录等）来证明仲裁条款的真实性和双方当事人的真实意思表示。如果这些证据能够形成完整的证据链，证明仲裁条款是双方真实意思的表示，且符合仲裁法的规定，那么仲裁条款仍然可能被认定为有效。
   • 然而，如果无法提供任何证据来证明仲裁条款的存在或其内容，或者提供的证据不足以证明仲裁条款的真实性和合法性，那么仲裁条款可能会被视为无效。因为在此情况下，无法确定双方当事人是否就仲裁达成了合意，也无法确定仲裁的具体事项和选定的仲裁委员会。

3. 特殊情况下的仲裁条款效力：

   • 在某些特殊情况下，即使合同原件缺失，仲裁条款也可能因其他因素而被认定为有效。例如，如果双方当事人在合同履行过程中已经实际按照仲裁条款进行了仲裁，且没有提出异议，那么可以视为双方对仲裁条款的认可和接受，此时仲裁条款的效力应得到确认。
   • 另外，如果合同原件的缺失是由于一方当事人的故意或过失造成的，且该行为导致了另一方当事人无法证明仲裁条款的存在或其内容，那么根据公平原则和诚实信用原则，法院或仲裁机构可能会倾向于认定仲裁条款有效，以保护无辜当事人的合法权益。

法律建议：

• 在签订合同时，务必确保合同原件的保存和备份，以避免因原件缺失而引发的纠纷。
• 如果合同原件确实缺失，应尽快收集其他相关证据来证明仲裁条款的真实性和合法性。
• 在涉及仲裁条款的纠纷中，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果仲裁条款被认定为有效，那么双方当事人应按照仲裁条款的约定进行仲裁，不得向法院提起诉讼。
• 如果仲裁条款被认定为无效或不存在，那么双方当事人之间的纠纷应通过诉讼或其他方式解决。