结论：当某案件经过两次退侦后仍然证据不足，检察院应依法作出不起诉决定或撤案决定（实践中撤案决定多由公安机关作出，检察院主要作出不起诉决定）。若检察院作出不起诉决定，被不起诉人及其相关权益将受到法律保护，同时公安机关和被害人也享有相应的监督和救济途径。

详细分析：

1. 检察院的决策依据与程序：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。这是检察院在审查案件时，对证据不足情况下的法定处理方式。
   • 决策程序：在案件经过两次退侦后，检察院会重新审查案件材料，包括公安机关补充侦查后提交的证据。若检察院认为证据仍然不足，无法支持起诉，则会依法作出不起诉决定。

2. 不起诉决定的法律后果：

   • 解除强制措施：一旦检察院作出不起诉决定，若犯罪嫌疑人在侦查或审查起诉阶段被采取了强制措施（如拘留、逮捕等），应立即解除这些强制措施，恢复其人身自由。
   • 封存相关记录（特定情况）：对于未成年人犯罪案件，若检察院作出不起诉决定，应按照法律规定对相关犯罪记录予以封存，以保护未成年人的隐私和未来发展。
   • 行政处罚与没收违法所得：若检察院决定不起诉，但对于被不起诉人需要给予行政处罚、处分或没收其违法所得的情况，检察院可以提出检察意见，移送有关主管机关处理。

3. 公安机关与被害人的监督与救济途径：

   • 公安机关的异议与复议复核：公安机关若认为检察院的不起诉决定有错误，可以要求复议；若意见不被接受，还可向上一级人民检察院提请复核，以确保司法决定的公正性和准确性。
   • 被害人的申诉：被害人对检察院的不起诉决定不服的，可在收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。人民检察院应将复查决定告知被害人，以保障其合法权益。

4. 其他可能情况与注意事项：

   • 提起公诉：虽然案件经过两次退侦后证据不足，但若后续发现了新的证据或线索，使得案件达到了事实清楚、证据确实充分的程度，检察院仍可依法提起公诉。
   • 法律原则的体现：不起诉决定体现了刑事诉讼中的“疑罪从无”原则，即在没有确凿证据的情况下，不能认定犯罪嫌疑人有罪并将其交付审判。这是保障公民合法权益、防止错误追诉的重要法律原则。

建议与行动指南：

• 若您或您身边的人面临类似情况，即案件经过两次退侦后仍然证据不足，建议保持冷静，及时咨询专业律师以了解具体法律程序和权益保障措施。
• 若检察院作出不起诉决定，您应了解并行使自己的监督与救济权利，如公安机关或被害人对决定有异议时，可依法提出复议、复核或申诉。
• 同时，您也应关注案件后续发展，如是否会有新的证据出现导致案件重新进入诉讼程序等，以便及时采取应对措施。

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