退侦两次后检察院作出不起诉决定的，案件将依法终结，但当事人可根据具体情况选择申诉、申请国家赔偿或启动民事赔偿程序。以下是具体分析：

1. 案件终结的法律效果
   根据《刑事诉讼法》第177条，检察院作出不起诉决定后，刑事诉讼程序即告终止，犯罪嫌疑人不再被追究刑事责任。此时公安机关应立即解除对当事人的强制措施（如取保候审、监视居住），并返还被扣押的财物。若当事人已被羁押，可依据《国家赔偿法》第17条申请国家赔偿（需满足“错误拘留”或“错误逮捕”条件）。

2. 当事人权利救济途径

   • 申诉权：若当事人认为不起诉决定有误（如证据不足被错误不起诉），可在收到决定书后7日内向上一级检察院申诉（《刑事诉讼法》第180条）。
     
   • 申请国家赔偿：若因错误羁押导致人身自由受损，可向作出不起诉决定的检察院提出赔偿申请，需提交释放证明、羁押记录等材料。
     
   • 民事赔偿请求：若案件涉及民事侵权（如故意伤害、财产损害），当事人可单独提起民事诉讼要求赔偿，此时需注意刑事诉讼中“证据标准高于民事诉讼”的特点，部分证据可能需重新举证。

3. 特殊情形处理

   • 存疑不起诉后的补充侦查：若检察院以“证据不足”作出不起诉决定，但发现新证据后，可依据《刑事诉讼法》第175条重新启动侦查程序。此时当事人需注意，若新证据达到“犯罪事实清楚，证据确实充分”标准，案件可能被重新起诉。
     
   • 附条件不起诉的考验期：若案件涉及未成年人或特定轻罪，检察院可能作出附条件不起诉决定（《刑事诉讼法》第282条），此时当事人需在考验期内遵守规定（如定期报告、禁止进入特定场所），否则可能被撤销决定并提起公诉。

建议行动步骤：

1. 核对不起诉决定书类型（法定不起诉/存疑不起诉/酌定不起诉），明确后续权利；
   
2. 若涉及财产返还或人身损害，及时联系办案机关办理财物发还手续；
   
3. 咨询律师评估是否符合国家赔偿条件或需启动民事诉讼；
   
4. 保留所有法律文书（如拘留通知、释放证明、不起诉决定书）作为后续维权依据。
   

如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我提供材料，我将结合证据情况为您制定应对方案。