刑事案件检察院退侦两次后，并非必须做出起诉或不起诉决定，而是要根据案件具体情况来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、退侦两次后的可能结果
不起诉决定：
- 法定不起诉：若经过两次退回补充侦查，检察院仍认为证据不足，无法证明犯罪事实系犯罪嫌疑人所为，或者虽有犯罪事实但并非该嫌疑人所为，检察院将依法作出不起诉决定。例如，关键物证、书证缺失，证人证言矛盾且无法排除合理怀疑，无其他有力证据支持等情形。
- 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或可免除刑罚的案件，即使经过两次补充侦查，检察院也可基于自由裁量权，考虑犯罪嫌疑人的初犯、偶犯身份，犯罪数额刚达立案标准，以及自首、立功、退赃退赔等情节，作出酌定不起诉决定。
- 存疑不起诉：若两次补充侦查后，证据仍无法达到确实、充分的标准，无法形成完整的证据链条来认定犯罪嫌疑人有罪，特别是在涉及复杂专业知识的案件中，鉴定意见不明确时，检察院将作出存疑不起诉决定。
提起公诉：
- 尽管案件被退回侦查两次，但若检察院认为经过补充侦查后的案件已经具备起诉条件，或者虽然存在某些问题但不影响提起公诉，检察院仍有权依法向法院提起公诉。例如，侦查机关通过补充侦查找到了新的关键证据，使得证据更加确实、充分，能够清晰证明犯罪嫌疑人的犯罪事实。
二、决定因素
- 证据的充分性与事实的清晰度：这是决定案件走向的关键因素。检察院在决定是否起诉时，会重点审查案件的证据是否充分、事实是否清晰。如果证据之间存在矛盾和疑点，且经过两次退侦仍无法得到合理解释和排除，导致无法形成完整、闭合的证据链，检察院不起诉的可能性增加。
- 法律的适用：检察院还需根据相关法律法规，综合评估案件是否符合起诉条件，以及是否存在依法不应当追究刑事责任的情形。例如，对于新兴领域或复杂法律关系中的案件，如果法律适用上存在争议，且经过两次退侦仍未有明确结论，检察院可能基于谨慎原则作出不起诉决定。
- 检察官的裁量权：检察官在决定是否起诉时，除严格遵守法律规定外，还享有一定的裁量权。他们会综合考虑案件的具体情况、社会影响、公众期待等因素，作出是否起诉的决策。
三、实际案例与法律建议
在实际操作中，退侦两次后是否起诉的案例屡见不鲜。有的案件因为证据不足或法律适用存在争议，最终检察院作出了不起诉决定；而有的案件则因为证据得到了充分补充，犯罪事实清楚明确，最终被依法提起公诉。
对于当事人而言，如果面临类似情况，建议保持冷静和理性，积极配合律师和检察机关的工作。同时，及时向我咨询，我会根据案件的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助，确保你的合法权益得到妥善维护。例如，我会帮你分析案件的证据情况、法律适用以及可能的法律后果，为你制定合适的辩护策略。
综上所述，退侦两次后检察院是否会做出起诉或不起诉决定，并非一个绝对确定的结果。它取决于案件的具体情况、证据的充分性、事实的清晰度以及法律的适用等因素。因此，在面对此类情况时，应寻求专业律师的帮助，以获取最准确的法律指导和建议。