员工在无法获取公司提供的离职单时，是可以自行撰写离职申请的。不过，在自行撰写的过程中，您需要确保几个关键点，以保障自身权益并顺利完成离职流程。
首先，法律依据方面，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者有权提前三十日（或在试用期内提前三日）以书面形式通知用人单位解除劳动合同。这里强调的是“书面形式通知”，并未规定必须使用公司特定的离职单格式。因此，只要您自行撰写的离职申请内容合法、形式合规，它就具有法律效力。
接下来，特殊情况处理。如果您的劳动合同或公司其他协议中明确规定了离职必须使用特定的离职单或遵循特定程序，那么您应当遵守这些约定，以避免可能的违约风险。
在实际操作上，我建议您：
与公司沟通协商：在无法获取公司正规离职单的情况下，首先尝试与人力资源部门或您的上级领导沟通，请求他们提供离职单或详细解释公司的离职流程。这有助于您更准确地了解离职要求，并确保您的离职申请符合公司规定。
自行撰写离职申请：如果沟通无果，您可以自行撰写离职信。在信中，请明确表达您的离职意愿、离职理由以及您的最后工作日期。确保信件内容清晰、无歧义，并符合法律及公司规定的要求。
保留证据：通过电子邮件、挂号信等可靠方式将离职信发送给公司的法定代表人、人力资源部门负责人或其他指定收件人。同时，保存好发送凭证，如邮件记录、邮寄回执等，作为您已经履行通知义务的证据。
后续处理：提交离职信后，积极与用人单位协商办理离职手续，包括工作交接、工资结算等。如果遇到用人单位不配合或存在违法行为，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
总之，虽然自行撰写离职申请是可行的，但您必须确保它符合法律及公司规定，并保留好相关证据。在离职过程中，积极与用人单位沟通协商，确保离职手续的顺利办理。如有需要，不要犹豫寻求法律帮助以维护自身权益。