公司可以主动解除竞业协议，但具体方式及后果需根据法律条款和实际情况来确定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、双方协商一致解除

1. 情况说明：如果用人单位和劳动者在平等自愿的基础上，就解除竞业限制协议达成一致意见，那么该协议可以被解除。这种方式体现了双方的自主意愿和对自身权利义务的处分，是最直接且双方都能接受的方式。
2. 法律效力：协商过程符合法律规定时，协议解除后对双方均具有法律约束力。双方应签订书面解除协议，明确解除的条件、时间、经济补偿等事项，以避免后续纠纷。

二、用人单位单方解除

1. 一般情况：原则上，用人单位不可以单方面无条件解除竞业限制协议。但在特定情况下，如企业经营战略调整、业务变化等导致竞业限制协议不再有履行的必要时，用人单位有权单方解除。
2. 经济补偿：根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第三十九条的规定，用人单位在单方解除竞业限制协议时，需要额外支付劳动者三个月的竞业限制经济补偿。这是法律对劳动者因协议解除而可能遭受的损失的一种补偿。
3. 法律支持：若用人单位请求解除竞业限制约定，并且符合相关法律规定（如确实存在不再需要履行协议的合理理由），人民法院通常会予以支持。

三、劳动者权益保护

1. 经济补偿金支付：如果用人单位违反竞业限制的约定，拒绝支付经济补偿金，劳动者在履行了竞业限制义务后，有权要求用人单位按照约定支付。这是劳动者的重要权利，也是竞业限制协议得以有效执行的重要保障。
2. 解除权：若因用人单位的原因导致三个月未支付经济补偿，根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第三十八条的规定，劳动者可以请求解除竞业限制约定，并仍有权要求用人单位支付已经履行的竞业限制期间的经济补偿。

四、实践建议

1. 谨慎行事：在处理竞业限制协议时，公司和员工都应谨慎行事，确保遵守相关法律法规和协议约定。任何一方违反协议约定，都可能面临法律责任和经济损失。
2. 及时咨询：如有任何疑问或争议，建议及时向我咨询以获取准确的法律帮助和指导。作为专业律师，我可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助双方避免可能的法律风险和经济损失。

综上所述，公司解除竞业限制协议的方式需根据具体情况而定，且往往涉及经济补偿的支付。在实际操作中，应充分考虑法律法规的要求和劳动者的合法权益，确保解除过程的合法性和合理性。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。