合同中约定工资包含加班费、延长时间工资及节假日工资，在一定条件下是合法的，但必须严格遵循相关法律法规的规定。以下从不同角度为您详细分析：
合法性基础与前提条件
法律基础：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定工资报酬及其支付方式。这意味着，双方有权在合同中明确工资构成，包括是否包含加班费等。
前提条件：
- 自愿协商：双方必须在平等、自愿的基础上进行协商，确保合同内容真实反映双方的意愿。任何一方不得强迫对方接受不合理的条款。
- 合理计算：加班费的计算必须符合国家规定的标准。具体来说，工作日加班应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付；休息日加班且不能安排补休的，应按照200%支付；法定休假日加班的，应按照300%支付。如果合同中约定的加班费低于这些标准，则可能被视为违法。
- 明确告知：用人单位必须向劳动者明确说明工资构成中包含加班费的情况，并在合同中明确约定。这有助于避免事后产生争议，确保双方的权益得到保障。
法律风险与注意事项
法律风险：
- 如果用人单位未依法支付加班费，或者约定的加班费低于国家规定的标准，劳动者有权要求用人单位补足差额部分。此外，在发生劳动争议时，用人单位需要承担举证责任，证明其已经按照法律规定支付了加班费。如果无法提供充分证据，可能面临败诉的风险。
实践中的注意事项：
- 合同条款清晰：在劳动合同中应明确约定工资构成、加班费计算方式及支付时间等关键条款。这有助于避免模糊不清导致后续纠纷。
- 保留证据：用人单位应妥善保存考勤记录、工资支付凭证等证据材料。这些证据在必要时可以证明用人单位已经依法支付了加班费。
- 合规操作：用人单位应严格遵守国家关于工作时间和休息休假的规定，合理安排劳动者的工作时间和休息时间。避免过度加班，确保劳动者的身心健康。
具体操作建议
- 审查合同条款：在签订劳动合同时，务必仔细审查合同条款，特别是关于工资构成和加班费的部分。确保合同内容符合法律法规的规定，并真实反映双方的意愿。
- 保留相关证据：作为劳动者，应保留好与工资支付相关的证据材料，如工资条、考勤记录等。这些证据在必要时可以维护自己的合法权益。
- 及时咨询与维权：如果发现用人单位未依法支付加班费或存在其他违法行为，应及时向用人单位提出异议，并咨询专业律师进行维权。
总之，合同中约定工资包含加班费、延长时间工资及节假日工资在一定条件下是合法的，但必须遵循相关法律法规的规定，并确保双方自愿协商、合理计算、明确告知。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。