生效判决认定抵押登记有效后，一般不可以另案主张撤销抵押登记，但在特定情形下可以。以下是对此问题的详细分析：
一、生效判决的既判力
生效判决具有既判力，即判决一旦生效，就对其所确定的权利义务关系产生终局性的法律效力。在抵押担保领域，如果生效判决已经明确认定抵押登记有效，那么这一认定就具有了法律上的确定力，非经法定程序，不得随意更改或撤销。
二、另案主张撤销抵押登记的障碍
一事不再理原则：
- 一事不再理是民事诉讼中的基本原则，即同一案件已经经过法院审理并作出判决后，当事人不得就同一事实和理由再次向法院提起诉讼。如果生效判决已经认定抵押登记有效，那么当事人再就同一抵押登记提起撤销之诉，就可能违反一事不再理原则。
既判力的约束：
- 既判力不仅约束当事人，也约束法院。在生效判决已经认定抵押登记有效的情况下，法院在后续的诉讼中一般应当尊重并维护这一认定，除非存在法定的事由可以推翻原判决。
三、特定情形下的例外
尽管生效判决认定抵押登记有效后，一般不可以另案主张撤销抵押登记，但在以下特定情形下，当事人可能仍有权提起撤销之诉：
新证据的出现：
- 如果当事人在生效判决作出后发现了新的证据，且这些证据足以证明原判决认定抵押登记有效的事实存在错误，那么当事人可以依据新证据提起撤销之诉。但需要注意的是，新证据应当是在原判决作出后才发现的，且足以改变原判决的结果。
原判决存在法定错误：
- 如果原判决存在违反法定程序、适用法律错误或认定事实错误等法定情形，且这些错误足以影响抵押登记效力的认定，那么当事人可以依据相关法律规定提起再审或撤销之诉。但这种情况较为罕见，且需要严格的法律程序和证据支持。
抵押登记存在法定撤销事由：
- 如果抵押登记本身存在法定撤销事由，如抵押物不存在、抵押权未设立、抵押登记程序违法等，且这些事由在生效判决作出后被发现或确认，那么当事人可以依据相关法律规定提起撤销之诉。但需要注意的是，这些撤销事由应当是在抵押登记时就已经存在的，且足以导致抵押登记无效或被撤销。
四、法律建议
尊重生效判决：
- 在没有法定事由的情况下，当事人应当尊重生效判决的既判力，不得随意提起撤销之诉。
谨慎行使诉讼权利：
- 如果当事人认为存在法定事由可以提起撤销之诉，应当谨慎行使诉讼权利，确保所依据的事实和理由充分、合法，并准备好相应的证据材料。
寻求专业法律帮助：
- 由于撤销抵押登记之诉涉及复杂的法律问题和证据认定，当事人可以寻求专业律师的帮助，以确保诉讼的顺利进行和合法权益的维护。
如果有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。