乙方是否可以拒绝甲方对新设备的功能改造要求，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、合同约定角度
合同中有明确约定：
- 如果双方签订的合同中明确规定了乙方有义务按照甲方的要求对新设备进行功能改造，或者合同中包含了类似“乙方需根据甲方需求对设备进行定制化改造”的条款，那么乙方通常不能拒绝甲方的要求。否则，乙方可能构成违约，需要承担相应的违约责任。
合同中没有明确约定：
- 如果合同中没有明确约定乙方有义务进行功能改造，那么乙方有权根据自身的技术能力、生产计划、成本考虑等因素来决定是否接受甲方的改造要求。在这种情况下，乙方拒绝甲方的要求并不构成违约。
二、法律规定角度
《民法典》相关规定：
- 根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果合同中没有明确约定，但甲方提出的功能改造要求合理且不违反法律法规的强制性规定，乙方在有能力且不影响自身正常经营的情况下，可以考虑接受甲方的要求。然而，这并不意味着乙方必须接受，因为乙方也有权保护自己的合法权益。
技术可行性及成本考虑：
- 乙方在决定是否接受甲方的功能改造要求时，还需要考虑技术可行性及成本因素。如果改造要求超出了乙方的技术能力范围，或者改造成本过高，导致乙方无法承受，那么乙方有权拒绝甲方的要求。
三、实际操作建议
沟通协商：
- 在面对甲方的功能改造要求时，乙方首先应与甲方进行充分的沟通协商，了解甲方的具体需求和期望，同时表达自己的立场和困难。通过沟通协商，双方可以寻求一个双方都能接受的解决方案。
评估风险与收益：
- 乙方在决定是否接受甲方的要求前，应对改造项目的风险与收益进行全面评估。如果改造项目能够带来显著的收益，且风险可控，那么乙方可以考虑接受甲方的要求。反之，如果改造项目风险过高或收益不明显，乙方则应谨慎考虑。
签订补充协议：
- 如果双方就功能改造事项达成一致意见，建议签订补充协议以明确双方的权利义务、改造内容、改造期限、费用承担等事项。这样可以避免后续因改造事项产生纠纷。
总结来说，乙方是否可以拒绝甲方对新设备的功能改造要求，需根据合同约定、法律规定以及实际操作中的技术可行性、成本考虑等因素来综合判断。在面对此类问题时，建议乙方与甲方进行充分的沟通协商，并寻求专业法律意见以保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。