在货物买卖合同纠纷中，若合同明确约定设备改造未达约定标准时甲方有权不支付货款，法院的判决会依据具体案情和证据来综合判定，但通常来说，会遵循以下逻辑和原则：
合同条款的效力：
- 首先，法院会审查合同中的相关条款，确认其是否合法有效。如果合同条款明确、具体，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该条款对双方当事人具有法律约束力。
- 在本案例中，若合同确实约定了“设备改造未达合同约定标准，甲方有权不支付货款”，且该条款合法有效，那么甲方在设备改造未达标的情况下，有权依据合同条款拒绝支付货款。
设备改造是否达标的认定：
- 法院会审查双方提供的证据，包括但不限于合同、技术规格书、验收报告、测试数据等，以确定设备改造是否达到了合同约定的标准。
- 如果甲方能够提供充分的证据证明设备改造未达标，且该未达标情况并非由甲方原因造成，那么法院可能会支持甲方不支付货款的请求。
- 反之，如果乙方能够证明设备改造已经达到了合同约定的标准，或者未达标情况是由甲方原因造成的，那么法院可能会驳回甲方不支付货款的请求。
违约责任的承担：
- 如果法院认定设备改造未达标，且该未达标情况构成乙方违约，那么乙方可能需要承担相应的违约责任，包括但不限于修理、重作、更换、退货、减少价款或者报酬等。
- 在某些情况下，如果乙方违约行为给甲方造成了其他损失，甲方还可以要求乙方赔偿损失。
特殊情况下的判决：
- 如果合同中存在免责条款或者双方对设备改造标准存在争议，且无法达成一致意见，法院可能会根据公平原则、诚实信用原则等法律原则进行判决。
- 另外，如果设备改造未达标是由于不可抗力等不可预见、不可避免的原因造成的，那么乙方可能不需要承担违约责任。
法律建议：
- 对于甲方而言，在签订合同时应明确设备改造的具体标准和验收流程，并在设备改造完成后及时进行验收和确认。如果发现设备改造未达标，应及时收集证据并通知乙方进行整改或协商解决方案。
- 对于乙方而言，在签订合同时应仔细审查合同条款，确保自己能够按照合同约定的标准完成设备改造。在设备改造过程中应严格按照技术规格书和合同要求进行操作，并保留好相关证据以备不时之需。
可能产生的法律后果：
- 如果法院判决甲方不支付货款，乙方可能需要承担违约责任并赔偿甲方因此遭受的损失。
- 如果法院判决甲方支付货款，甲方则需要按照合同约定履行付款义务，否则可能面临被强制执行的风险。
总结来说，法院在判决此类纠纷时会综合考虑合同条款的效力、设备改造是否达标的认定、违约责任的承担以及特殊情况下的判决等因素。因此，在签订和履行货物买卖合同时，双方当事人应谨慎对待合同条款的约定和履行过程中的每一个环节，以避免不必要的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。