结论：能否起诉房东，取决于房东是否存在违约行为或欺诈行为，以及这些行为是否直接导致了你无法办理营业执照。如果存在相关情况，你可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
分析：
合同关系角度：
- 如果你与房东签订了租赁合同，并且合同中明确规定了房屋的使用性质（如商业用途）以及房东应提供的条件（如房屋合法性、可办理营业执照等），而房东提供的房屋存在违建问题，导致你无法办理营业执照，那么房东可能构成了违约。
- 在此情况下，你可以依据租赁合同的约定，要求房东承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、解除合同等。如果房东拒绝承担责任，你可以考虑通过法律途径起诉房东。
欺诈行为角度：
- 如果房东在出租房屋时，明知房屋存在违建问题，却故意隐瞒或虚假陈述，导致你基于错误认识而签订了租赁合同，那么房东可能构成了欺诈。
- 在此情况下，你可以依据《民法典》的相关规定，主张撤销租赁合同，并要求房东赔偿因此造成的损失。如果房东拒绝赔偿，你同样可以考虑通过法律途径起诉房东。
实际损失与因果关系角度：
- 无论房东是否构成违约或欺诈，你都需要证明自己因无法办理营业执照而遭受了实际损失，并且这些损失与房东的行为之间存在因果关系。
- 例如，你可能需要提供证据证明因无法办理营业执照而导致的业务停滞、客户流失、收入减少等损失。如果无法证明这些损失与房东的行为之间存在因果关系，那么你的起诉可能会面临困难。
建议：
- 在决定是否起诉房东之前，建议你先收集相关证据，包括租赁合同、房屋违建证明、无法办理营业执照的证明以及因此遭受的损失证明等。
- 你可以尝试与房东进行协商，看是否能够达成和解或赔偿协议。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
- 如果你决定起诉房东，建议你咨询专业律师（当然，你可以直接向我咨询），以便更好地了解自己的权益和诉讼风险，并制定合适的诉讼策略。
法律后果：
- 如果法院认定房东存在违约或欺诈行为，并判决房东承担赔偿责任，那么房东需要按照判决书的约定履行赔偿义务。
- 如果房东拒绝履行判决书的义务，你可以向法院申请强制执行，法院将依法采取强制措施迫使房东履行义务。