当工人工伤认定后，且老板已经垫付了医药费，接下来您可以按照以下步骤来处理，以确保您的合法权益得到充分保障：
一、确认工伤认定与劳动能力鉴定情况
确认工伤认定：
- 确保工伤认定已经完成，且认定结果符合实际情况。如果尚未进行工伤认定，或者对认定结果有异议，应及时向社会保险行政部门提出申请或复议。
进行劳动能力鉴定：
- 如果伤情稳定后存在残疾或影响劳动能力，应向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出鉴定申请。劳动能力鉴定结论将作为确定赔偿标准的重要依据。
二、处理垫付的医药费
确认工伤保险赔付情况：
- 联系当地的社会保险经办机构，确认工伤保险是否已经全额赔付了医疗费用。这是关键步骤，因为工伤保险的赔付将直接影响您是否需要归还老板垫付的费用。
归还或保留垫付费用：
- 如果工伤保险已经全额赔付了医疗费用，那么您应将老板垫付的费用归还给老板，或者与老板协商处理这部分费用。
- 如果工伤保险未能全额赔付，未赔付的部分应由用人单位（即老板）承担。在这种情况下，您无需归还老板垫付的全部费用，但应保留好相关证据，以备后续需要。
三、申请工伤赔偿
了解赔偿项目：
- 工伤赔偿包括医疗费（如有未支付的合理医疗费用）、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金等。根据伤残等级不同，具体赔偿标准也不同。
申请赔偿流程：
- 首先尝试与用人单位（老板）协商赔偿事宜，明确赔偿项目和金额。
- 如果协商不成，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交仲裁申请书及相关证据材料，如工伤认定书、劳动能力鉴定结论、医疗费用票据等。
- 对仲裁结果不服的，可以在规定期限内向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、保留证据与维护权益
保留所有相关证据：
- 在整个过程中，您应特别注意保留所有与工伤有关的证据材料，如医疗费用票据、病历、诊断证明、工伤认定书、劳动能力鉴定结论等。这些证据将是您申请赔偿和维权的重要依据。
及时维护自身权益：
- 如果遇到任何问题或争议，如工伤保险机构或用人单位拒绝报销或支付医药费、赔偿金额不合理等，您应及时向当地劳动保障行政部门咨询或投诉。
- 必要时，您可以寻求律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，当工人工伤认定后且老板已经垫付了医药费时，您应确认工伤认定与劳动能力鉴定情况、处理垫付的医药费、申请工伤赔偿，并保留证据与维护权益。希望这些建议能对您有所帮助。