公司签协议时法人不知情也没有授权，该协议一般不能生效，且可能不合法。以下从不同角度进行详细分析：
一、协议生效的法定条件
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。在公司签订协议的场景中，若法人不知情且未授权，则签订协议的行为可能不满足“意思表示真实”这一条件，因为法人作为公司的代表，其不知情即意味着公司没有真实的意思表示。
二、法人授权的重要性
表见代表与表见代理的区分：
- 若签订协议的人是公司员工，且持有公司公章或合同专用章，但未经法人授权，此时可能构成表见代理。然而，表见代理的成立需要满足相对人（即协议另一方）有理由相信行为人有代理权的条件。若相对人明知或应知行为人无代理权，则不构成表见代理，协议可能无效。
- 若签订协议的人并非公司员工，或虽为公司员工但无任何公司授权文件，则更不可能构成表见代理，协议很可能无效。
法人授权的必要性：
- 法人授权是公司对外签订协议的重要法律程序。未经法人授权，任何人不得以公司名义对外签订协议。否则，公司有权拒绝承认该协议的效力，并可能追究相关人员的法律责任。
三、协议无效的法律后果
若协议因法人不知情且未授权而无效，则协议自始没有法律约束力。此时，协议双方应恢复原状，即返还因协议取得的财产或利益。若因协议无效给一方造成损失的，有过错的一方应承担赔偿责任。
四、特殊情况下的协议效力
事后追认：
- 若法人事后对协议进行了追认，即表示法人同意该协议的内容，并愿意承担协议约定的权利和义务，则协议可能因追认而生效。
表见代表的特殊情形：
- 在某些特殊情况下，如公司法定代表人超越权限签订协议，但相对人（协议另一方）有理由相信其有权限的，该协议可能对公司发生效力。然而，这种情况需要严格的证据支持，且相对人必须尽到合理的审查义务。
五、法律建议
公司应建立健全授权制度：
- 公司应明确授权范围、授权期限和授权方式，确保公司对外签订协议的行为合法有效。
相对人应尽到审查义务：
- 在与公司签订协议时，相对人应尽到合理的审查义务，如要求对方提供法人授权文件、公司营业执照等证明材料，以确保协议的合法性和有效性。
及时咨询专业律师：
- 若遇到公司签协议时法人不知情也没有授权的情况，建议及时咨询专业律师，以了解具体的法律后果和应对措施。
总结来看，公司签协议时法人不知情也没有授权，该协议一般不能生效，且可能不合法。公司应建立健全授权制度，相对人应尽到审查义务，并在遇到问题时及时咨询专业律师。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。