针对您提出的问题，即“公司业务以医保暂停为由让员工长期休息超过三个月是否合法”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确的是，公司以医保暂停为由让员工长期休息，并不构成合法的解除劳动合同或长期放假的理由。医保暂停可能涉及公司社保缴纳的问题，但这并不直接关联到员工的劳动权利和劳动合同的履行。公司不能因为医保暂停就单方面决定让员工长期休息，这种行为可能侵犯了员工的合法权益。

接下来，我们参考相关的法律法规和案例：

1. 根据《中华人民共和国劳动合同法》：用人单位与劳动者解除劳动关系，应当严格遵循法定程序及实体要件。公司单方面以医保暂停为由让员工长期休息，并未履行协商、通知等法定程序，因此可能构成违法解除劳动合同或违法剥夺劳动者提供劳动的权利。

2. 参考类似案例：如您提供的案例中，小林因公司无限期放假、删除门禁权限、停缴社保等行为，最终被法院认定为违法解除劳动合同，并判决公司支付赔偿金。这表明，公司不能随意以非法定理由让员工长期休息或解除劳动合同。

3. 关于停工留薪期的政策：虽然停工留薪期是针对工伤职工的特殊政策，但其中也明确了在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付，且用人单位不得解除或终止劳动关系。这进一步说明了，公司不能随意以非工伤、非法定理由让员工长期休息而不支付工资或解除劳动合同。

综上所述，公司以医保暂停为由让员工长期休息超过三个月，并不合法。这种行为可能侵犯了员工的劳动权利，员工有权要求公司继续履行劳动合同或主张赔偿金。

因此，建议您：

• 与公司进行沟通，明确要求公司恢复您的劳动条件，并支付相应的工资和福利。
• 如果公司拒绝履行义务，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
• 在整个过程中，保留好相关的证据，如劳动合同、工资单、公司通知等，以便在需要时提供证明。