针对您提出的“被告超过答辩期限提出管辖权异议应当如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、通常情况下的处理原则

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间（通常为收到起诉状副本之日起十五日内）提出。这是法律明确规定的提出管辖权异议的期间。若被告超过这一期限提出管辖权异议，法院原则上将不再进行审查，而是直接驳回或不予受理。这是因为答辩期是保障诉讼程序有序推进和效率的重要机制，超期提出异议可能导致诉讼程序的拖延和混乱。同时，若被告在超过答辩期后应诉答辩，将被视为受诉人民法院有管辖权，除非该管辖违反级别管辖和专属管辖的规定。

二、特殊情况下的处理方式

尽管一般情况下超过答辩期提出的管辖权异议不会被受理，但在某些特殊情况下，法院可能会进行特殊处理：

1. 法院依职权审查：

   • 如果法院在审理案件过程中自行发现案件可能存在管辖权问题（如法律关系性质变化影响管辖权确定），即使当事人超期提出管辖权异议，法院依然可以依职权对管辖权进行审查，并将案件移送至有管辖权的法院。

2. 默示协议管辖：

   • 在被告超期提出管辖权异议后，如果双方当事人就案件的实体问题进行了实质性辩论，且未再坚持管辖权异议问题，也未提出其他关于管辖权的合理反对意见，那么有可能被视为双方以实际行动达成了默示协议管辖，即双方认可受该法院管辖。

3. 正当理由顺延：

   • 如果被告确有正当理由未能在答辩期间提出管辖权异议（如因不可抗力或其他正当原因），并且能够提供充分证据加以证明，法院可能会允许当事人在障碍消除后的10日内申请顺延期间，以保障其提出管辖权异议的权利。

三、建议与总结

对于被告而言，在诉讼过程中应当严格遵守法律规定的时限，及时行使自己的权利，包括提出管辖权异议的权利。若因特殊原因错过法定期间，应尽快向法院说明情况并提供充分证据，以争取法院的特殊处理。同时，被告也应意识到，超期提出管辖权异议可能面临不被受理的风险，因此应谨慎对待。

对于法院而言，在处理此类情况时应遵循法律规定和诉讼程序的要求，确保诉讼的公正、高效和有序进行。在驳回管辖权异议或视为应诉答辩后，法院将继续按照既定程序审理案件，并保障当事人的上诉权利（但上诉理由应限于实体争议而非管辖问题）。

希望以上解答能够对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。