结论前置：合同上写了仲裁条款，一般情况下当事人不能直接向法院起诉，但在特定情形下可以向法院寻求救济。以下是对这一问题的详细分析：
一、仲裁协议的效力及执行
仲裁条款的有效性：
- 合同中约定的仲裁条款，只要内容符合法律法规，一般视为有效。有效的仲裁条款应包含请求仲裁的意思表示、明确的仲裁事项以及选定的仲裁委员会。
- 仲裁协议是双方当事人自愿达成的，约定将可能发生的争议提交给特定仲裁机构进行裁决，该协议一旦符合法定的有效要件，即对双方具有法律约束力。
仲裁的自愿性原则：
- 当事人采用仲裁方式解决纠纷应基于双方自愿，并达成仲裁协议。无仲裁协议时，一方申请仲裁，仲裁委员会将不予受理。
仲裁条款的执行：
- 合同中约定了仲裁条款，在发生合同纠纷时，当事人必须按照约定申请仲裁解决纠纷，这排除了法院对该争议的管辖权。根据《中华人民共和国仲裁法》第五条的规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。
二、不能直接起诉，应先仲裁的情形
- 在合同中明确约定了有效的仲裁条款的情况下，当事人应当遵守这一约定，将争议提交给约定的仲裁机构进行仲裁，而不能直接向法院提起诉讼。
三、可以向法院起诉的特殊情形
仲裁协议无效：
- 如果仲裁协议存在法定无效的情形，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围（例如涉及婚姻、收养、监护、抚养、继承等纠纷）、无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等，那么该仲裁协议无效，当事人可以向法院起诉。
仲裁机构无管辖权或仲裁程序违法：
- 如果仲裁机构对争议没有管辖权，或者仲裁程序违反法定程序，当事人也可以向法院申请确认仲裁协议的效力或申请撤销仲裁裁决，进而可能通过法院解决纠纷。
仲裁裁决被撤销或不予执行：
- 仲裁裁决作出后，如果当事人有证据证明仲裁裁决存在《仲裁法》规定的可撤销情形（如没有仲裁协议、裁决的事项不属于仲裁协议的范围或仲裁委员会无权仲裁、仲裁庭的组成或仲裁程序违反法定程序等），可以向法院申请撤销仲裁裁决。同样，在执行阶段，如果法院裁定不予执行仲裁裁决，当事人也可以就该纠纷向法院提起诉讼。
双方放弃仲裁协议：
- 如果一方向法院起诉时，没有向法院声明双方存在仲裁协议，而另一方在首次开庭前也未对法院受理该案提出异议，那么这将被视为双方放弃了仲裁协议。此时，法院可以继续审理该案。
四、实际操作建议
- 在处理涉及仲裁协议的纠纷时，当事人应首先审查仲裁协议的有效性。若仲裁协议有效，则应依约通过仲裁解决纠纷；若仲裁协议无效或存在其他特定情形（如上述可起诉的特殊情形），则可以考虑向法院提起诉讼。
- 鉴于仲裁协议的严肃性和法律效力，双方在签订合同时应仔细考虑是否选择仲裁以及仲裁条款的具体内容。建议明确约定仲裁机构、仲裁规则、仲裁地点等关键信息，以确保日后发生争议时能够顺利启动仲裁程序并得到有效解决。
总结：合同上写了仲裁条款，并不意味着当事人完全丧失了向法院起诉的权利。在特定情形下（如仲裁协议无效、仲裁裁决被撤销等），当事人仍然可以向法院寻求救济。因此，在签订合同时务必谨慎对待仲裁条款的设定，并在发生纠纷时根据具体情况选择合适的争议解决方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。