针对您提出的问题，即“公司用营业执照和员工自己的身份证办电话号，离职了怎么办”，这是一个涉及个人信息保护、合同权益以及电信服务合同关系的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、个人信息保护角度
根据《中华人民共和国个人信息保护法》的相关规定，个人信息的处理应当遵循合法、正当、必要的原则，并取得个人的同意。在您的情况下，公司使用您的身份证信息办理电话号码，实际上是在处理您的个人信息。当您离职后，您有权撤回之前对公司使用您个人信息的同意。
建议行动：
- 您应首先与公司沟通，明确表达您希望撤回对使用您个人信息办理电话号码的同意，并要求公司采取措施（如销号或变更实名认证信息）以保护您的个人信息不被滥用。
- 如果公司拒绝配合，您可以考虑向当地的劳动争议调解组织或个人信息保护监管机构寻求帮助。
二、合同权益角度
如果公司使用您的身份证办理电话号码是基于某种合同关系（如劳动合同或特定服务协议），那么您需要查看合同中关于此类情况的约定。如果合同中没有明确约定离职后电话号码的归属问题，那么根据一般原则，您作为个人信息权利人，有权要求公司停止使用您的个人信息。
建议行动：
- 仔细审查您与公司签订的劳动合同或相关协议，看是否有关于工作号码归属的明确条款。
- 如果没有相关条款，或者条款不明确，您可以与公司协商解决，或者依据相关法律法规维护自己的权益。
三、电信服务合同关系角度
从电信服务合同的角度来看，电话号码的使用权通常与电信服务合同相关联。如果公司是以自己的名义（如使用营业执照）与电信运营商签订服务合同，但实际使用人是您，那么在您离职后，公司可能需要与电信运营商协商变更或终止服务合同。
实际案例参考：
- 参考江苏省泰州市高港区人民法院审理的一起类似案件，法院最终判令电信运营商将案涉手机号码的使用权人变更登记为原登记户主（即公司）。这表明，在未经原登记户主同意的情况下，擅自变更电话号码的使用权人是违法的。
建议行动：
- 如果公司拒绝配合变更或销号，您可以要求公司出示与电信运营商签订的服务合同，并查看合同中关于服务终止和号码变更的条款。
- 如果公司无法提供合理解决方案，您可以考虑直接联系电信运营商，说明情况并要求其协助处理。
四、综合建议
- 与公司沟通：首先尝试与公司进行友好沟通，明确表达您的诉求和担忧。
- 审查合同：仔细审查您与公司签订的相关合同或协议，看是否有关于此类情况的明确约定。
- 寻求法律帮助：如果公司拒绝配合或无法提供合理解决方案，您可以考虑咨询律师或向当地的劳动争议调解组织、个人信息保护监管机构寻求帮助。
- 保护个人信息：在处理此类问题时，务必注意保护您的个人信息不被滥用或泄露。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。