综合工时制下，若在综合计算周期内总实际工作时间超过总法定标准工作时间，且超过部分未依法支付加班工资或未经劳动行政部门批准实行综合工时制，则构成违法。以下是对此问题的详细分析：
一、综合工时制的定义与规定
综合计算工时工作制，是指企业因生产特点无法实行标准工时制，而经劳动行政部门批准，以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。其核心在于，在一个综合计算周期内，劳动者的平均日工作时间和周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
二、违法超时的认定标准
未经批准实行综合工时制：
- 企业若未经劳动行政部门批准，擅自实行综合工时制，即构成违法。在此情况下，无论劳动者实际工作时间是否超过法定标准，企业均需承担违法责任。
综合计算周期内超时工作：
- 在获得劳动行政部门批准实行综合工时制后，企业仍需确保在一个综合计算周期内，劳动者的总实际工作时间不超过总法定标准工作时间。若超过，且超过部分未依法支付加班工资，则构成违法。
- 具体来说，假设一个综合计算周期为一个月，法定标准工作时间为168小时（即21天×8小时）。若劳动者在该月内实际工作了200小时，则超时32小时。若这32小时未依法支付加班工资，企业即构成违法。
三、违法超时的法律后果
行政处罚：
- 根据《劳动保障监察条例》等相关规定，劳动保障行政部门有权对违法超时的企业给予警告、责令限期改正，并可处以罚款。
劳动者权益保护：
- 劳动者有权拒绝企业的违法超时安排，并可通过与用人单位协商、申请劳动仲裁或向劳动监察部门投诉等途径维护自身权益。
- 若因违法超时导致劳动者权益受损，如健康受损、家庭生活受影响等，劳动者还有权要求企业承担相应的赔偿责任。
四、建议与措施
企业应严格遵守工时制度：
- 在实行综合工时制前，企业应依法向劳动行政部门申请并获得批准。
- 在实行过程中，企业应确保劳动者的总实际工作时间不超过总法定标准工作时间，并依法支付加班工资。
劳动者应增强维权意识：
- 劳动者应了解自己的工时制度及权益，若发现企业存在违法超时行为，应及时向劳动监察部门投诉举报。
- 在维权过程中，劳动者应保留好相关证据，如工作记录、加班通知等，以便在需要时提供证明。
作为邓青青律师，我建议您在遇到类似问题时，首先确认企业是否已依法实行综合工时制，并核实自己的实际工作时间是否超过法定标准。若存在疑问或发现企业存在违法行为，请及时向我咨询或向劳动监察部门投诉举报。