结论：房屋买卖中存在虚假流水且合同目的已实现超过三年时间，一般情况下，向法院起诉要求确认合同无效可能会面临一定的困难，但并非绝对不可行，需结合具体情况分析。
一、关于合同无效的法律规定
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同无效的情形主要包括：无民事行为能力人实施的民事法律行为；行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为；违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为（但该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外）；违背公序良俗的民事法律行为；以及行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为。虚假流水可能涉及“以虚假的意思表示实施的民事法律行为”或“恶意串通，损害他人合法权益”的情形，但具体需结合事实判断。
二、关于诉讼时效
诉讼时效的一般规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效的起算点：
- 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在房屋买卖合同中，如果买方在合同签订时或之后不久就发现了虚假流水的问题，并且知道或应当知道这可能导致合同无效，那么诉讼时效可能从此时开始计算。
超过诉讼时效的后果：
- 如果超过诉讼时效期间，权利人向人民法院起诉的，被告可以提出诉讼时效抗辩，人民法院经审理认为抗辩事由成立的，将判决驳回权利人的诉讼请求。但需注意，如果被告未提出诉讼时效抗辩，人民法院不应对诉讼时效问题进行释明及主动适用诉讼时效的规定进行裁判。
三、结合具体情况的分析
如果买方在三年内未发现虚假流水或未意识到其影响：
- 在这种情况下，买方可能仍然有权向法院起诉要求确认合同无效，但需要提供充分的证据证明其在三年内确实不知道或不应知道虚假流水的存在及其影响。这在实际操作中可能较为困难。
如果买方在三年内已经发现虚假流水但未及时起诉：
- 在这种情况下，买方可能面临被告提出诉讼时效抗辩的风险。如果法院认定诉讼时效期间已经届满，买方的诉讼请求可能会被驳回。
关于合同目的已实现的影响：
- 合同目的的实现并不直接影响合同无效的认定，但可能作为法院在判断合同是否应被宣告无效时的考虑因素之一。如果合同目的已经实现，且没有造成其他损害，法院可能更倾向于维持合同的效力。
四、建议与风险提示
- 及时咨询与行动：如果您发现房屋买卖合同中存在虚假流水的情况，并且认为这可能导致合同无效，建议您尽快咨询专业律师并考虑向法院起诉。拖延时间可能会增加诉讼时效抗辩的风险。
- 收集证据：在起诉前，您需要收集充分的证据来证明虚假流水的存在及其对合同效力的影响。这可能包括合同文本、流水记录、沟通记录等。
- 考虑其他救济途径：如果诉讼时效期间已经届满或法院认定合同有效，您还可以考虑通过其他途径来维护自己的权益，如要求卖方承担违约责任或赔偿损失等。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述分析仅供参考。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。