如果自己被认定上工伤但公司不认，公司是有可能会起诉的，但具体是否起诉以及起诉后的结果，需视情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司起诉的可能性及原因
对工伤认定结果有异议：
- 公司可能认为您的受伤情况不符合工伤认定的标准，或者认为工伤认定过程中存在程序瑕疵，因此选择通过法律途径来挑战工伤认定结果。
经济利益考虑：
- 工伤赔偿可能涉及较大的经济支出，包括医疗费、伤残补助金、停工留薪期工资等。公司可能出于减少经济损失的考虑，选择对工伤认定结果提起诉讼。
二、公司起诉后的法律程序及可能结果
行政复议或行政诉讼：
- 如果公司对工伤认定结果不服，它可以先向作出工伤认定的劳动保障行政部门申请行政复议。对行政复议结果仍不服的，公司可以向人民法院提起行政诉讼。
- 在这个过程中，法院会审查工伤认定的合法性，包括认定程序是否合法、事实是否清楚、证据是否充分等。
可能结果：
- 维持原工伤认定结果：如果法院认为工伤认定合法有效，那么原工伤认定结果将被维持，公司需要承担相应的工伤赔偿责任。
- 撤销或变更工伤认定结果：如果法院认为工伤认定存在违法或不当之处，可能会撤销或变更原工伤认定结果。这种情况下，您可能需要重新申请工伤认定或面临无法获得工伤赔偿的风险。
三、您的应对策略及建议
保留证据：
- 无论公司是否起诉，您都应妥善保留与工伤相关的所有证据，包括医疗记录、工伤认定决定书、与公司的沟通记录等。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
积极应诉：
- 如果公司选择起诉，您应积极应诉，配合法院的调查和审理工作。您可以委托律师代理诉讼，以确保您的合法权益得到充分维护。
寻求法律援助：
- 如果您在经济上存在困难，无法承担律师费用，您可以向当地法律援助机构申请法律援助。法律援助机构将为您提供免费的法律服务。
四、法律背景及依据
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
- 如果用人单位未按规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。对受理的事实清楚、权利义务明确的工伤认定申请，社会保险行政部门应当在15日内作出工伤认定的决定。
最后，建议您在面对此类情况时保持冷静，及时咨询并委托专业律师处理，以确保您的合法权益得到最大程度的维护。如果您有任何关于劳动工伤方面的法律问题，都可以直接向我咨询。