当被告申请鉴定而原告拒绝时，法院可能会推定被告对相关证据的主张成立，原告可能因此承担不利后果。以下是对此问题的详细分析：

一、法律后果

1. 推定被告主张成立：

   • 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》的相关条款，若原告无正当理由拒绝配合鉴定，法院可以推定被告对这份证据的主张成立。这意味着，在原告不提供反驳证据且无正当理由拒绝鉴定的情况下，法院将倾向于采纳被告的观点，认定该证据的有效性。

2. 原告承担不利后果：

   • 原告拒绝鉴定可能导致法院对其产生不利影响，甚至可能因此承担败诉的风险。因为鉴定是查明案件事实的重要手段，原告拒绝鉴定可能被视为对诉讼权利的不当行使，影响法院对案件事实的认定和判决的公正性。

二、原告拒绝鉴定的可能原因及应对

1. 无正当理由拒绝：

   • 如果原告没有合理的理由拒绝鉴定，比如担心鉴定结果对自己不利，那么这种拒绝可能是不理智的。在这种情况下，原告应该认识到鉴定的必要性，并考虑配合鉴定以维护自己的合法权益。

2. 有正当理由拒绝：

   • 如果原告有合理的理由拒绝鉴定，比如鉴定机构不具备相关资质、鉴定程序违法等，那么原告可以向法院提出异议，并要求重新指定鉴定机构或进行其他合法程序。在这种情况下，原告应该积极收集证据，以支持自己的异议。

三、建议与注意事项

1. 充分评估自身情况：

   • 原告在面临鉴定申请时，应充分评估自身情况，包括证据的充分性、鉴定可能带来的结果等。在权衡利弊后，作出明智的选择。

2. 积极配合鉴定程序：

   • 如果原告认为鉴定是必要的，并且没有合理的理由拒绝，那么应该积极配合鉴定程序，提供必要的样本和材料。这有助于查明案件事实，维护自己的合法权益。

3. 尊重法院判决：

   • 无论鉴定结果如何，原告都应该尊重法院的判决。如果对判决结果有异议，可以通过合法途径提出上诉或申请再审。

举例说明：

假设在一个合同纠纷案件中，被告申请对合同上的笔迹进行鉴定，以证明合同的真实性。而原告拒绝配合鉴定，认为合同是伪造的。在这种情况下，如果原告没有合理的理由拒绝鉴定，比如没有提供证据证明鉴定机构不具备资质或鉴定程序违法等，那么法院可能会推定被告的主张成立，即合同是真实的。这将对原告产生不利影响，甚至可能导致原告承担败诉的风险。

因此，原告在面临被告申请鉴定时，应慎重考虑并积极配合鉴定程序，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。